核心结论：员工盗窃公司财产后退回，公司仍可依法追究其法律责任，但退回行为可能作为量刑情节予以考虑。具体处理需结合盗窃金额、情节严重性及公司制度综合判断。以下是详细分析：

1. 法律定性：盗窃行为不因退回而免责

• 根据《刑法》第264条，盗窃公私财物数额较大或多次盗窃、入户盗窃等情形，构成盗窃罪。退回赃款赃物属于“退赃”情节，可依法从轻或减轻处罚，但不改变盗窃行为的违法性。
• 即使员工事后退回财产，公司仍有权报警，由公安机关立案侦查。若盗窃金额达到刑事立案标准（如数额较大，通常为1000元至3000元以上，具体因地而异），员工可能面临刑事处罚。

2. 公司处理：内部制度与法律程序并行

• 内部处理：公司可依据《劳动合同法》及内部规章制度，对员工进行纪律处分，如警告、记过、解除劳动合同等。需注意：
  • 解除劳动合同需符合法定情形（如严重违反规章制度），且程序合法（如提前通知工会）。
  • 若员工行为涉嫌犯罪，公司可暂停其工作，配合司法机关调查。
• 民事赔偿：公司可要求员工赔偿因盗窃造成的直接经济损失（如财物损坏、停工损失等），即使财产已退回，仍可主张间接损失。

3. 量刑影响：退赃是重要从宽情节

• 根据《最高人民法院、最高人民检察院关于办理盗窃刑事案件适用法律若干问题的解释》，退赃、退赔可减少基准刑的30%以下。
• 若员工系初犯、偶犯，且主动退赃、认罪悔罪，可能争取不起诉或缓刑。但若存在多次盗窃、携带凶器等加重情节，退赃的从宽幅度会降低。

4. 实务建议：公司应采取的步骤

• 固定证据：立即封存被盗财物、监控录像、出入记录等，避免证据灭失。
• 报警处理：向公安机关提交报案材料，包括财物价值证明、退赃情况说明等。
• 内部追责：依据规章制度启动纪律处分程序，确保程序合法。
• 协商解决：若金额较小，可考虑与员工协商赔偿及离职事宜，但需签订书面协议避免后续纠纷。

提示：具体处理需结合盗窃金额、员工主观恶性、公司损失程度等因素综合判断。如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供详细方案。