公司更改员工手册是否违法，需视具体情况而定，但未经法定程序擅自修改通常构成违法。以下从不同角度为你详细分析：
一、修改程序的合法性
法定程序要求：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条的规定，用人单位在制定、修改或者决定直接涉及劳动者切身利益的规章制度或重大事项时，应当经过职工代表大会或者全体职工讨论，并与工会或者职工代表平等协商确定。这是修改员工手册必须遵循的法定程序。
擅自修改的违法性：
- 如果公司未经上述法定程序，单方面擅自修改员工手册，那么这种修改行为是违法的。修改后的员工手册因缺乏合法程序支持，不具有法律效力，不能作为管理员工的依据。
二、修改内容的合法性
内容不得违反法律法规：
- 即使公司按照法定程序修改了员工手册，修改后的内容也不得违反国家法律法规、行政法规及政策规定。如果修改内容违反了这些规定，那么修改行为同样构成违法。
内容需公示或告知劳动者：
- 根据法律规定，用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。如果公司修改员工手册后未进行公示或告知，也可能构成违法。
三、员工应对措施及法律后果
员工有权反对并拒绝接受：
- 对于公司擅自修改的员工手册，员工有权表示异议并拒绝接受。特别是当修改内容违反法律法规或行业规范，或者损害员工切身利益时，员工的反对更为合理。
公司可能面临的法律后果：
- 如果公司因员工反对擅自修改员工手册而采取不利措施（如开除、降薪等），可能构成违法解除劳动合同或违法变更劳动合同。员工有权通过法律途径维护自己的合法权益，包括申请劳动仲裁和提起诉讼，要求公司承担相应的法律责任。
四、具体建议
收集证据：
- 如果公司擅自修改了员工手册，员工应尽快收集相关证据，如修改前后的员工手册文本、相关通知、邮件等，以证明公司的违法行为。
与公司协商：
- 在收集到足够证据后，员工可以尝试与公司进行友好协商，指出公司修改员工手册程序违法及可能带来的法律后果，要求公司恢复原状或采取其他补救措施。
寻求法律救济：
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，请求裁决公司修改员工手册的行为违法，并要求公司承担相应的法律责任。如果对仲裁结果不满意，还可以在规定期限内向人民法院提起诉讼。
总结来说，公司更改员工手册是否违法，关键在于是否遵循了法定程序以及修改内容是否合法。如果公司未经法定程序擅自修改员工手册，或者修改内容违反法律法规，那么这种修改行为是违法的。员工有权通过法律途径维护自己的合法权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。