公司有未收回的工程款，一般不可以直接注销。下面我将从多个角度为你详细分析这个问题：

一、法律层面

从法律角度来看，公司在注销前需要完成清算程序，包括清理债权债务。未收回的工程款属于公司的债权，是公司资产的一部分。在清算过程中，公司应当积极追讨这些债权，以确保公司资产的完整性和债权人的利益。如果公司在未清理完债权债务的情况下直接注销，可能会面临法律风险和责任。

具体来说，根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记。在清算过程中，如果发现公司财产不足清偿债务的，应当依法向人民法院申请宣告破产。因此，如果公司有未收回的工程款，且这些款项对于公司的债务清偿有重要影响，那么公司在注销前必须妥善处理这些债权，否则可能无法完成清算程序，也无法合法注销。

二、实际操作层面

在实际操作中，如果公司确实存在未收回的工程款，且这些款项难以追回或者追回成本过高，公司可以考虑以下几种方式处理：

1. 与债务人协商：尝试与债务人进行协商，达成还款协议或者债务重组方案，以尽可能回收债权。
2. 法律途径：如果协商无果，公司可以通过法律途径追讨债权，如提起诉讼或者申请仲裁等。
3. 债权转让：在符合法律规定的情况下，公司可以将债权转让给第三方，以回收部分资金。

在处理完这些债权后，公司再按照法定程序进行清算和注销。

三、潜在风险

如果公司未妥善处理未收回的工程款而直接注销，可能会面临以下风险：

1. 法律责任：公司可能因未履行清算义务而承担法律责任，如被债权人起诉要求赔偿等。
2. 信用受损：公司的注销可能影响其信用记录，对未来可能的商业活动产生不利影响。
3. 股东责任：在某些情况下，股东可能需要对公司的债务承担连带责任，特别是当公司存在恶意注销或者未履行清算义务时。

建议：公司在考虑注销前，应当全面清理债权债务，确保所有债权得到妥善处理。如果确实存在难以追回的工程款，建议咨询专业律师，制定合适的处理方案，以降低法律风险和责任。如果你有进一步的法律问题或者需要具体的法律建议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供详细的解答。