公司有未收回的货款时，是可以进行注销的，但在此过程中需要谨慎处理相关的债权债务问题，以避免潜在的法律风险。

从法律程序上来看，公司在注销前需要依法进行清算。在这个过程中，未收回的货款应当被列为公司债权进行清理和追收。如果公司在注销后发现还有未处理的债权债务，那么原股东可能会因此承担责任。因此，在注销前，公司应尽可能通过协商、诉讼等方式追讨货款。

如果确实无法收回货款，那么在清算报告中需要如实披露这一债权情况，并确保整个清算程序的合法合规，从而避免日后可能出现的法律纠纷。这样做不仅是为了保障各方的合法权益，也是为了降低潜在的法律风险。

具体来说，公司在注销前应梳理所有未收回货款的明细，并与欠款方进行沟通协商。如果协商无果，应准备诉讼材料，详细整理交易凭证等证据。在清算时，未收回货款的情况需要被清晰记录在清算报告中，以确保整个过程的合法合规。

此外，值得注意的是，公司注销后其法人资格将消灭，原则上不能再以原公司名义追收货款。因此，如果未提前做好妥善安排，这笔货款可能无法有效收回。这也是为什么在注销前需要积极追收货款，并在清算报告中如实说明情况的原因。

总的来说，虽然公司有未收回的货款时可以注销，但在此过程中必须谨慎处理债权债务问题，遵循法定清算程序，以降低潜在的法律风险，并保障各方的合法权益。