机关工勤人员自行离职，需根据具体情况承担相应法律后果并妥善处理后续事宜，核心结论如下：

1. 自行离职可能构成违法解除劳动合同，需承担赔偿责任
   根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者解除劳动合同需提前30日（试用期3日）书面通知用人单位。若机关工勤人员未履行通知义务直接离职，可能被认定为违法解除劳动合同。此时，若因离职给单位造成损失（如未完成工作交接导致项目停滞、重要文件遗失等），单位有权依据《劳动合同法》第九十条要求赔偿实际损失。例如，某机关工勤人员未交接财务账目导致审计延误，法院最终判决其赔偿单位因此支付的额外审计费用。

2. 社保与档案转移需主动配合，否则影响后续权益
   离职后，单位需在15日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续（《劳动合同法》第五十条）。若工勤人员自行离职且未配合办理，单位可能暂缓转移手续，导致其无法在新单位参保或享受失业保险待遇。此时，工勤人员可向劳动监察部门投诉，要求单位履行义务；若单位拒不办理，还可申请劳动仲裁，主张单位配合转移手续并赔偿因延误导致的损失（如医保断缴期间的医疗费用）。

3. 服务期或竞业限制协议可能引发额外责任
   若工勤人员与单位签订过服务期协议（如单位提供专项培训费用并约定服务期），或竞业限制协议（如掌握单位商业秘密），自行离职可能触发违约责任。根据《劳动合同法》第二十二条，违反服务期协议需支付违约金（金额不超过单位提供的培训费用）；根据第二十三条，违反竞业限制协议需支付违约金并继续履行竞业限制义务。例如，某机关工勤人员接受单位出资的技能培训后未满服务期离职，法院判决其按未履行服务期比例返还培训费用。

建议行动步骤：

• 第一步：书面提交离职申请：即使决定离职，也应按《劳动合同法》要求提前通知单位，并保留送达证据（如邮寄回执、微信记录）；
  
• 第二步：办理工作交接：主动与单位协商交接时间，列明交接清单（如文件、设备、客户信息等），避免因交接不清被追责；
  
• 第三步：确认社保与档案转移：离职后1个月内联系单位确认手续办理进度，若单位拖延，可向当地劳动监察大队投诉或申请仲裁；
  
• 第四步：审查合同条款：检查劳动合同中是否有服务期、竞业限制等特殊条款，若有疑问可直接向我咨询具体应对方案。
  

机关工勤人员离职涉及劳动法、合同法等多重法律关系，建议根据自身情况谨慎处理。如有进一步疑问，可直接向我提问，我会结合具体细节为您详细分析。