核心结论：在交通事故双方已签订调解协议后保险公司拒赔的情况下，需根据不同情形采取相应措施，可能涉及协议效力、保险条款、理赔程序等多方面因素。以下分情况详细说明：

1. 调解协议效力问题

   • 若调解协议是双方真实意思表示，内容不违反法律法规强制性规定和公序良俗，且不存在欺诈、胁迫、重大误解、显失公平等可撤销或无效情形，那么该协议是合法有效的。保险公司以不合理理由拒赔，可能构成违约。例如，协议中明确约定了赔偿项目、金额及支付方式等，保险公司应按照协议履行赔偿义务。
   • 若调解协议存在上述可撤销或无效情形，保险公司可能以此为由拒赔。比如，一方在签订协议时受到对方胁迫，导致协议内容并非其真实意愿，此时可向法院申请撤销该协议，之后根据实际情况重新确定赔偿责任，再向保险公司主张理赔。

2. 保险条款限制问题

   • 仔细审查保险合同条款，看是否存在对理赔的特殊限制或免责条款。有些保险条款可能规定某些情况下保险公司不承担赔偿责任，如被保险人故意制造交通事故、酒驾、无证驾驶等。如果事故存在这些情形，且保险条款明确约定免责，那么保险公司拒赔可能是合理的。
   • 若保险条款中关于拒赔的约定存在模糊不清、歧义或不合理之处，根据法律规定，应作出有利于被保险人和受益人的解释。例如，保险条款对某种事故情形的界定不明确，导致双方对是否属于理赔范围产生争议，此时应倾向于认定属于理赔范围，保险公司不应拒赔。

3. 理赔程序问题

   • 保险公司拒赔可能是因被保险人未按照规定的理赔程序申请赔偿。比如，未在规定时间内报案、未提供完整的理赔资料等。在这种情况下，被保险人应及时补充完善相关手续，按照保险公司要求重新提交理赔申请。
   • 若被保险人已严格按照理赔程序操作，保险公司仍无正当理由拒赔，被保险人可以向保险公司提出书面异议，要求其说明拒赔的具体理由和依据。若保险公司无法给出合理说明，被保险人可以通过法律途径维护自己的合法权益，如向当地保险监管部门投诉或向法院提起诉讼。

建议措施：

• 首先，收集与事故、调解协议、保险合同相关的所有证据材料，包括事故认定书、调解协议原件、保险合同、理赔申请资料等。
• 其次，与保险公司进行沟通协商，要求其出具书面拒赔通知书，明确拒赔原因。根据拒赔原因，针对性地提供反驳证据和理由，争取通过协商解决问题。
• 若协商无果，可以向当地保险行业协会或保险监管部门反映情况，寻求他们的调解和帮助。
• 最后，必要时向法院提起诉讼，通过法律程序解决纠纷。在诉讼过程中，要充分举证，证明自己的主张，以维护自身合法权益。