员工因不能胜任工作被辞退时，是否有赔偿取决于辞退行为的合法性及具体情形。以下是对此问题的详细分析：

一、合法辞退情形下的经济补偿

1. 试用期内的解除：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条第一项，若员工在试用期内被证明不符合录用条件（如不能胜任工作且经过培训或调整工作岗位仍不能胜任），用人单位可以辞退劳动者而无需支付经济补偿金。

2. 试用期外的解除：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条第二项，员工过了试用期后，若不能胜任工作，且经过培训或者调整工作岗位仍不能胜任，用人单位需提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，方可解除劳动合同。
   • 同时，根据该法第四十六条，用人单位在此种情况下解除劳动合同的，应当向劳动者支付经济补偿。经济补偿的计算方式为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。这里的月工资指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

二、违法辞退情形下的赔偿金

• 如果用人单位无法证明劳动者不能胜任工作，或者未对不能胜任工作的劳动者进行培训或调整工作岗位，就直接以不能胜任工作为由辞退员工，这构成违法解除劳动合同。
• 根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条，用人单位违反本法规定解除或终止劳动合同的，应依照该法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。赔偿金计算公式为：赔偿金 = 经济补偿 × 2 = （工作年限 × 月工资）× 2（其中，工作年限和月工资的计算方式同上）。

三、特殊情况下的责任

• 如果劳动者不能胜任工作是由于用人单位未提供适当的培训或劳动条件造成的，用人单位在解除劳动合同时可能需要承担更大的责任，包括但不限于支付额外的经济补偿或赔偿金。
• 对于月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的员工，向其支付的经济补偿标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。

四、实际案例分析

• 假设员工小张在某公司工作了2年零8个月，月平均工资为10000元。若公司以小张不能胜任工作且经过培训后仍不能胜任为由合法解除劳动合同，则需向小张支付3个月工资的经济补偿，即30000元。若公司未提前三十日书面通知，还需额外支付一个月工资10000元。
• 若公司无任何证据证明小张不能胜任工作就直接将其辞退，则属于违法解除劳动合同，应向小张支付赔偿金。赔偿金将为经济补偿（3×10000=30000元）的二倍，即60000元。

综上所述，员工因不能胜任工作被辞退时的赔偿问题需根据具体情况判断。建议面临此类情况的劳动者或用人单位直接向我咨询，以获取准确的法律意见和帮助。