结论：在劳动仲裁阶段，若两位被申请人均不适格，您确实可以在法院起诉阶段直接调整被告主体，但需确保新被告符合法律规定的主体资格，并遵循相应的法律程序。
分析说明：
仲裁被申请人不适格的处理：
- 在劳动仲裁过程中，如果发现被申请人不适格（即被申请人不具备作为劳动争议当事人的法律资格，如非用人单位、非与争议事项有直接利害关系的主体等），仲裁机构可能会以被申请人不适格为由不予受理或驳回仲裁申请。
- 此时，您作为申请人，有权根据法律规定，向有管辖权的人民法院提起诉讼，以寻求法律救济。
法院起诉阶段的被告主体调整：
- 在向法院起诉时，您有权根据实际情况调整被告主体。如果原仲裁阶段的被申请人确实不适格，您可以在起诉状中明确指出，并请求法院将适格的主体列为被告。
- 法院在受理案件后，会对被告的主体资格进行审查。如果确认原被告不适格，而新被告符合法律规定的主体资格，法院会依法进行审理。
法律程序与注意事项：
- 在调整被告主体时，您需要确保新被告与争议事项有直接利害关系，且符合法律规定的主体资格（如用人单位、与争议事项相关的其他主体等）。
- 您还需要遵循法院的诉讼程序，如提交起诉状、证据材料等，并按照法院的要求参与诉讼活动。
- 如果在诉讼过程中发现需要追加或变更被告，您可以向法院提出申请，并说明理由。法院会根据实际情况决定是否准许。
行动建议：
- 准备充分证据：在向法院起诉前，您需要收集并整理好与争议事项相关的证据材料，以证明您的主张和请求。
- 明确诉讼请求：在起诉状中，您需要明确列出您的诉讼请求，包括要求确认劳动关系、支付工资、赔偿损失等具体事项。
- 遵循法律程序：在诉讼过程中，您需要遵循法院的诉讼程序和要求，积极参与诉讼活动，并按时提交相关材料。
- 咨询专业律师：如果您对法律程序或实体问题存在疑问或不确定之处，建议及时咨询专业律师，以获取更具体、更专业的法律建议。
法律后果：
- 如果您在法院起诉阶段成功调整了被告主体，并证明了您的主张和请求，法院可能会判决适格的被告承担相应的法律责任。
- 如果您未能提供充分证据或未能遵循法律程序，可能会导致您的诉讼请求被驳回或法院判决不利于您的情况。
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