在部分产品质量不合格的情况下，对方公司是否能拒付货款，需根据具体情况综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、可以拒付货款的情况
合同明确约定：
- 如果买卖双方在合同中明确规定了货物的质量标准，并约定在货物不符合该标准时买方有权拒付货款或拒收货物，那么当部分货物确实不合格时，买方可以依据合同条款拒绝支付相应货款或拒收不合格货物。
- 示例：合同约定交付的货物必须达到某项质量标准，否则买方有权拒付货款。若实际交付的货物部分未达到该标准，买方可以拒付这部分货物的货款。
根本违约情形：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，如果卖方交付的部分货物不合格导致合同目的无法实现，构成根本违约，买方不仅有权拒绝支付这部分货物的货款，还有权解除合同并要求赔偿损失。
- 示例：买方为特定活动采购的定制物品中，部分物品不符合要求，导致活动无法进行，即构成根本违约。买方可以拒付这部分不合格货物的货款，并要求解除合同及赔偿。
同时履行抗辩权：
- 在双务合同中，如双方没有约定先后履行顺序，应同时履行。若卖方交付的部分货物不合格，买方有权行使同时履行抗辩权，拒绝支付相应货款。
- 示例：买卖合同中未约定货款支付与货物交付的先后顺序，卖方交付的部分货物存在质量问题，买方可以拒绝支付这部分货物的货款，直至卖方提供合格货物。
二、不能拒付货款的情况
轻微瑕疵不影响使用：
- 如果货物仅存在轻微的质量问题，且这些问题并不影响其基本使用功能和整体性能，买方不能直接拒绝支付全部货款。此时，买方可以要求卖方承担修理、更换或减少价款等违约责任，但通常不能直接拒付货款。
- 示例：购买的家具表面有轻微划痕，不影响正常使用，买方可以要求卖方修复划痕或减少价款，但不能直接拒付货款。
已接受货物且未及时提出异议：
- 买方在接收货物后，应按照约定的时间和方式对货物进行检验。如果买方在检验期内未通知卖方货物不合格，或者自收到货物之日起二年内（或有质量保证期的适用质量保证期）未提出异议，则视为货物数量和质量符合约定。在这种情况下，买方不能以部分货物不合格为由拒绝支付货款。
- 示例：买方在收到货物后未及时检验，或检验后未在合理期限内通知卖方货物不合格，之后以部分货物不合格为由拒绝支付货款，可能不被支持。
三、行动建议
沟通协商：
- 在发现部分货物不合格后，买方应首先与卖方进行沟通，明确表达不满并提出具体要求，如退货、换货、修理或赔偿等。通过友好协商解决问题是首选方式。
收集证据：
- 买方应确保有充分的证据来证明货物的不合格性，包括检验报告、照片、视频、沟通记录等。这些证据将在后续的法律纠纷中发挥关键作用。
法律途径：
- 如果沟通协商无果，买方可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。这包括向法院提起诉讼或申请仲裁等。在提起诉讼或申请仲裁前，建议买方咨询专业律师以获取更具体的法律建议和支持。
总结：在部分产品质量不合格的情况下，对方公司是否能拒付货款取决于具体情况。在符合合同约定或法律规定的情况下，买方有权拒绝支付相应货款并采取相应的法律措施来保护自己的合法权益。然而，在采取行动前，买方应充分了解相关法律法规和合同条款，并确保自己有充分的证据来支持自己的主张。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。