不动产权抵押给银行是合法的，但关键在于是否依法办理了抵押登记手续。以下从多个角度对此问题进行详细分析：

一、不动产抵押的法律依据

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，债务人或第三人有权处分的建筑物和其他土地附着物可以抵押，且应当办理抵押登记。抵押权自登记时设立。这意味着，不动产抵押的合法性并不取决于不动产权证是否抵押在银行，而是取决于是否依法办理了抵押登记。登记是确立抵押效力的关键环节，是保障银行抵押权的法定要求和有效措施。

二、不动产权证的保管与实际操作

在实际操作中，不动产权证的保管方式因地区和银行的不同而有所差异：

1. 不动产权证抵押在银行：

   • 某些地区和银行出于风险防控的考虑，会选择将不动产权证留在银行。这种做法虽然没有明确的法律条文依据，但银行认为持有证书能在借款人可能存在违约风险时增加谈判筹码。然而，这并不意味着抵押的合法性取决于证书的保管，而是取决于抵押登记的办理。

2. 不动产权证不抵押在银行：

   • 现在更多地区和银行在办理不动产抵押登记后，不再留存不动产权证书，而是由产权人自行保管。银行会获得不动产登记证明（如《不动产登记证明》），以此证明其对该不动产享有抵押权。这种做法更符合不动产抵押登记制度的核心，即通过登记来保障抵押权人的权益。

三、贷款合同与具体操作流程的决定性作用

不动产权证的保管问题主要取决于借款人与银行之间的贷款合同以及实际的操作流程。有些银行可能会要求借款人将不动产权证交由银行保管，但也有一些情况下，不动产权证会由借款人自己保管，而银行只保留抵押登记的证明文件。无论哪种情况，只要依法办理了抵押登记，抵押就是合法的。

四、法律建议与风险提示

1. 办理抵押登记：在将不动产抵押给银行时，务必确保依法办理了抵押登记手续。这是保障抵押权人权益的关键步骤，也是抵押合法性的重要依据。

2. 仔细阅读合同条款：在签订贷款合同时，务必仔细阅读合同条款，了解并明确不动产权证的保管方式及相关责任义务。这有助于避免后续因保管问题产生的纠纷。

3. 咨询专业人士：如果您对不动产抵押的相关法律问题存在疑虑或困惑，建议直接向我咨询。我可以根据您的具体情况和所在地的法律法规，为您提供更详细和准确的解答及建议。

综上所述，不动产权抵押给银行是合法的，但关键在于是否依法办理了抵押登记手续。在办理抵押时，请务必遵循相关法律法规和操作流程，以确保自身权益得到妥善保护。