结论前置：公司通常不可以仅以员工有乙肝大三阳为由辞退员工，这种行为可能构成违法解除劳动合同，公司需承担相应的法律责任。不过，在极少数特殊情况下，如果员工的乙肝病情严重影响工作且无法调整岗位，或者员工从事的是法律、行政法规和国务院卫生行政部门规定禁止乙肝病原携带者从事的易使传染病扩散的工作，公司可能依法解除劳动合同，但需遵循严格的法律程序并给予相应补偿。
一般情形下的法律规定与权益保护
反就业歧视原则：
- 根据《中华人民共和国就业促进法》第三十条，用人单位招用人员时，不得以是传染病病原携带者为由拒绝录用，乙肝病毒携带者同样享有平等的就业权利。这意味着，公司不能仅因员工患有乙肝大三阳就将其辞退，否则将构成就业歧视，违反法律规定。
违法解除劳动合同的后果：
- 如果公司违法以乙肝为由辞退员工，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，公司需承担法律责任。员工有权要求公司继续履行劳动合同，或者要求公司支付赔偿金。赔偿金的标准为经济补偿标准的二倍，经济补偿则根据员工在公司的工作年限和工资水平来确定。
隐私保护与人格尊严：
- 公司在处理员工健康信息时，应尊重员工的隐私权和人格尊严，避免不必要的伤害和歧视。公司应加强员工健康教育，提高员工对乙肝等传染病的认识，以消除恐慌和误解。
特殊情形下的合法处理
特定行业的限制：
- 对于法律、行政法规和国务院卫生行政部门规定禁止乙肝病原携带者从事的易使传染病扩散的工作（如食品行业的直接入口食品生产经营、医疗卫生行业的某些直接接触患者的工作等），如果员工被查出患有乙肝大三阳且不适合该工作岗位，公司有权进行调岗。但调岗前，公司应确保员工已经过医学鉴定，并确认其确实不适合从事原岗位工作。
调岗与解除合同的程序：
- 如果员工无法从事新安排的工作，也不能胜任其他工作，公司应提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资后，方可解除劳动合同。在此过程中，公司需依法支付经济补偿，经济补偿的标准同样根据员工在公司的工作年限和工资水平来确定。
员工应对策略与建议
- 与公司协商：如果员工被公司以乙肝大三阳为由辞退，应首先尝试与公司沟通，表明公司的辞退行为可能违法，并要求公司恢复劳动关系或给予合法补偿。
- 申请劳动仲裁：如果协商不成，员工可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，提交相关证据（如劳动合同、辞退通知、医疗证明等）来支持自己的主张。
- 提起诉讼：如果对仲裁结果不满意，员工还可以向人民法院提起诉讼，进一步维护自己的合法权益。
举例说明：假设某员工在公司工作多年，突然被公司以患有乙肝大三阳为由辞退。员工可以首先与公司沟通，要求公司出示辞退的合法依据。如果公司无法提供合法依据，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司恢复劳动关系或支付赔偿金。如果仲裁结果对员工有利，但公司仍不履行义务，员工可以向人民法院提起诉讼，要求公司承担法律责任。
总之，公司不能仅以员工有乙肝大三阳为由辞退员工。如果员工遇到此类情况，应积极维护自己的合法权益，必要时寻求法律帮助。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。