偷盗超市东西超过3000元，若构成犯罪，则会留下案底；若不构成犯罪，则通常不会留下案底。以下是对此问题的详细分析：
一、不会留案底的情况（未构成犯罪）
情节较轻，未达到立案标准：
- 虽然您提到的偷盗金额超过了3000元，但具体是否构成犯罪还需考虑当地的盗窃罪立案标准。一般来说，盗窃罪的立案标准在1000元至3000元以上，但具体数额因地区而异。如果3000元并未达到您所在地区的盗窃罪立案标准，且不存在多次盗窃、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃等严重情节，那么该行为可能仅属于违反《治安管理处罚法》的行为，不构成犯罪，因此不会留下案底。
- 在这种情况下，公安机关会根据《治安管理处罚法》第四十九条的规定，对行为人进行处罚，如拘留和罚款，但这些记录不属于犯罪记录，不会形成案底。
特殊情形下的不予处罚：
- 对于不满十四周岁的人、精神病人在不能辨认或控制自己行为时实施的偷窃行为，以及盗窃行为情节特别轻微且符合特定条件的情况（如初次盗窃、金额虽超但接近立案标准下限、主动归还并取得谅解等），公安机关可能会作出不予处罚的决定，因此也不会留下案底。不过，这种情况较为特殊，且需要满足一定的条件。
二、会留案底的情况（构成犯罪）
达到盗窃罪立案标准：
- 如果3000元已经达到了您所在地区的盗窃罪立案标准，或者存在多次盗窃（二年内盗窃三次以上）、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃等情形，那么该行为就构成了盗窃罪，会被依法追究刑事责任，并因此留下案底。
- 根据《刑法》第二百六十四条的规定，犯盗窃罪者将面临不同程度的刑罚，包括有期徒刑、拘役、管制、罚金等。一旦被判处刑罚，就会形成犯罪记录，即案底，该记录将被存入个人档案并长期保存。
未成年人犯罪的特殊规定：
- 虽然未成年人犯罪在某些情况下可能受到特殊处理，如从轻或减轻处罚等，但如果盗窃金额较大或存在上述严重情节，即便未成年人也会受到刑事处罚并留下案底。
总结与建议
- 法律后果：偷盗超市东西超过3000元是否留案底，关键在于是否构成犯罪。构成犯罪则留案底，不构成则不留。
- 建议行动：如果您或您身边的人涉及此类情况，建议尽快咨询专业律师（即向我咨询），了解具体的法律后果和可能的辩护策略。同时，应积极配合公安机关的调查工作，如实陈述事实，争取从轻或减轻处罚。
- 预防措施：为了避免不必要的法律风险和负面影响，建议公众严格遵守法律法规和道德规范，坚决杜绝任何形式的偷窃行为。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。