结论前置：用人单位或相关方在员工未乘坐劳务包车的情况下扣除车费是否合法，需分情况讨论，具体如下：
若劳动合同或规章制度中有明确约定：
- 合法性分析：根据《劳动合同法》第三条，劳动者与用人单位在订立劳动合同时应遵循平等自愿、协商一致的原则。若劳动合同或经民主程序制定的规章制度中明确约定了“员工需乘坐劳务包车，并承担相应费用，未乘坐者仍需支付车费”，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，则该约定对双方具有约束力。在此情况下，用人单位扣除车费的行为可能被视为合法。
- 建议：员工应仔细审查劳动合同及规章制度中的相关条款，若确实存在此类约定，且认为约定不合理或存在显失公平的情况，可尝试与用人单位协商修改或解除该约定。若协商无果，可考虑通过劳动争议调解、仲裁或诉讼等途径维护自身权益。
若劳动合同或规章制度中无明确约定：
- 合法性分析：在缺乏明确约定的情况下，用人单位单方面扣除员工车费的行为可能缺乏法律依据。根据《劳动法》及相关规定，用人单位不得随意克扣劳动者工资，除非因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失，且用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但在此情况下，未乘坐劳务包车并不直接等同于给用人单位造成经济损失，因此用人单位扣除车费的行为可能构成违法。
- 建议：员工可首先与用人单位沟通，要求其提供扣除车费的合法依据。若用人单位无法提供，员工可向当地劳动监察部门投诉，要求用人单位返还被扣除的车费。若投诉无果，员工还可考虑通过劳动争议仲裁或诉讼等途径维护自身权益。
额外提醒：
- 在处理此类纠纷时，员工应保留好相关证据，如劳动合同、规章制度、工资条、扣除车费的通知等，以便在需要时提供证明。
- 若员工对法律程序不熟悉或担心自身权益无法得到有效保障，可寻求专业法律人士的帮助，以确保自身权益得到妥善维护。
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