结论前置：用人单位因劳动者擅自离职（自离）而扣除其所有工资是违法的。除非用人单位能证明劳动者的擅自离职行为给其造成了实际经济损失，并依据相关规定扣除部分工资作为赔偿，否则应按时足额支付劳动者的工资。

详细分析：

1. 工资支付义务：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这是用人单位的基本义务，也是劳动者权益的重要保障。

2. 擅自离职（自离）的定义与性质：

   • 擅自离职，即自动离职，是指劳动者未按照法律规定或用人单位规章制度，未经批准或未履行相关手续擅自离开工作岗位，解除与用人单位的劳动关系。虽然这种行为可能违反了劳动合同的约定和用人单位的规章制度，但并不构成用人单位扣除全部工资的法律依据。

3. 经济损失的赔偿：

   • 若劳动者的擅自离职行为确实给用人单位造成了实际经济损失，根据《工资支付暂行规定》第十六条，用人单位可要求劳动者赔偿经济损失，并从其工资中扣除。但扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。这是为了保护劳动者的基本生活需求，防止用人单位过度扣除工资。

4. 劳动者的维权途径：

   • 若用人单位以劳动者擅自离职为由扣除了其所有或部分工资，劳动者可通过以下途径维护合法权益：
     • 与用人单位协商：首先尝试与用人单位沟通，要求其支付被扣除的工资。
     • 向当地劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令用人单位限期支付。
     • 向劳动争议仲裁委员会申请仲裁：若对劳动监察部门的处理结果不满意，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求支付工资及相应的经济补偿。
     • 向人民法院提起诉讼：对仲裁结果不服的，可向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的权益。

举例说明： 假设某劳动者因个人原因擅自离职，用人单位因此扣除了其全部工资。但用人单位无法证明该劳动者的离职行为给其造成了实际经济损失，或者即使造成了损失，扣除的工资也超过了劳动者当月工资的20%或低于当地月最低工资标准。在这种情况下，劳动者的权益就受到了侵害，他可以通过上述维权途径来维护自己的合法权益。

总结与建议： 劳动者的擅自离职行为虽然可能违反了劳动合同的约定和用人单位的规章制度，但这并不构成用人单位扣除其全部工资的法律依据。用人单位应当按时足额支付劳动者的工资，除非能证明因劳动者的擅自离职造成了实际经济损失，并按照相关规定进行扣除。作为劳动者，在面临此类问题时，应知晓自己的权益，并通过合法途径进行维权。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。