政府采购中不能签订合同的正当理由主要包括以下几种情况：

1. 供应商不具备法定资格或条件

   • 法律依据：根据《中华人民共和国政府采购法》第二十二条，供应商参加政府采购活动应当具备下列条件：（一）具有独立承担民事责任的能力；（二）具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度；（三）具有履行合同所必需的设备和专业技术能力；（四）有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录；（五）参加政府采购活动前三年内，在经营活动中没有重大违法记录；（六）法律、行政法规规定的其他条件。若供应商不符合上述任一条件，采购人可拒绝与其签订合同。
   • 举例说明：若供应商未提供有效的营业执照、税务登记证等证明文件，或存在重大违法记录（如偷税漏税、行贿受贿等），采购人可依法拒绝签订合同。

2. 采购文件存在重大歧义或错误

   • 法律依据：采购文件是政府采购活动的重要依据，若其内容存在重大歧义、错误或遗漏，可能导致采购结果不公平、不公正。根据《中华人民共和国政府采购法》及相关规定，采购人应在采购文件发布前进行仔细审查，确保其内容准确无误。若采购文件存在重大问题，采购人应暂停采购活动，并重新编制采购文件。
   • 举例说明：若采购文件中的技术规格、数量、价格等关键信息存在歧义或错误，导致供应商无法准确理解采购需求，采购人可依法拒绝签订合同，并重新组织采购活动。

3. 采购过程存在违法行为

   • 法律依据：政府采购活动应遵循公开、公平、公正和诚实信用的原则。若采购过程中存在违法行为（如串通投标、虚假应标、行贿受贿等），采购人应依法取消相关供应商的投标资格，并拒绝与其签订合同。
   • 举例说明：若发现供应商在投标过程中存在串通投标行为，或提供虚假材料谋取中标，采购人可依法取消其中标资格，并拒绝签订合同。同时，采购人还应向相关部门报告，依法追究相关责任人的法律责任。

4. 采购项目发生重大变更或取消

   • 法律依据：在政府采购过程中，若因政策调整、规划变更等原因导致采购项目发生重大变更或取消，采购人应及时通知所有供应商，并依法处理相关事宜。若采购项目已无法继续进行，采购人可拒绝签订合同。
   • 举例说明：若因政府规划调整导致原采购项目无法实施，或采购项目因资金问题无法继续推进，采购人可依法取消采购活动，并拒绝签订合同。同时，采购人还应妥善处理已提交的投标文件、保证金等事宜。

5. 供应商未能在规定时间内签订合同

   • 法律依据：根据《中华人民共和国政府采购法》及相关规定，中标、成交供应商应在收到中标、成交通知书后，按照采购文件确定的事项与采购人签订政府采购合同。若供应商未能在规定时间内签订合同，且无正当理由，采购人可依法取消其中标、成交资格，并拒绝签订合同。
   • 举例说明：若中标供应商在收到中标通知书后，因自身原因（如内部审批流程繁琐、人员变动等）未能在规定时间内与采购人签订合同，且未提前向采购人说明情况并征得同意，采购人可依法取消其中标资格，并拒绝签订合同。

在处理政府采购不能签订合同的情况时，采购人应严格遵守相关法律法规和程序要求，确保采购活动的合法性和公正性。 若您在政府采购过程中遇到相关问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。