工程质保单只保留电子版在多数情况下是可以的，但具体还需根据相关法律法规、合同约定以及实际需求来确定。以下从不同角度为你详细分析：

从法律法规角度

目前，并没有明确的法律法规强制规定工程质保单必须保留纸质版。电子版文件在符合一定条件下，如具有可靠的电子签名、能够完整呈现质保单内容、不易被篡改等，其法律效力是可以得到认可的。根据《中华人民共和国电子签名法》等相关规定，电子签名与手写签名或者盖章具有同等的法律效力，只要电子质保单的制作、存储、传输等过程符合法律要求，就可以作为有效的法律文件使用。

从合同约定角度

如果工程合同中明确约定了质保单的保留形式，比如要求必须保留纸质版，那么双方就应当按照合同约定执行。因为合同是双方意思自治的体现，具有法律约束力。在这种情况下，如果只保留电子版质保单，可能会构成违约行为，需要承担相应的违约责任。如果合同中没有明确约定质保单的保留形式，那么双方可以协商确定，或者根据行业惯例、交易习惯等来确定。

从实际需求角度

1. 便于保存和查阅：电子版质保单具有存储方便、占用空间小、易于查阅等优点。特别是对于大型工程项目，质保单数量众多，如果全部采用纸质版保存，不仅需要大量的存储空间，而且在查阅时也会非常不便。而电子版质保单可以通过计算机、手机等设备随时随地进行查阅，大大提高了工作效率。
2. 环保节能：采用电子版质保单可以减少纸张的使用，符合环保节能的理念。在当前全球倡导绿色发展的大背景下，这一优势也显得尤为重要。
3. 可能存在的风险：虽然电子版质保单具有诸多优点，但也存在一些潜在的风险。比如，电子数据容易被篡改、丢失或损坏，如果存储设备出现故障或者受到网络攻击，可能会导致质保单数据丢失或损坏。此外，电子版质保单的证明力在某些情况下可能不如纸质版强，特别是在涉及法律纠纷时，可能需要通过专业的技术手段来证明其真实性和完整性。

建议

1. 在合同中明确约定：为了避免不必要的纠纷，建议在工程合同中明确约定质保单的保留形式。如果双方同意采用电子版质保单，可以在合同中约定电子质保单的制作、存储、传输等要求，以及双方的权利和义务。
2. 做好备份和加密工作：为了确保电子版质保单的安全性和完整性，建议做好备份和加密工作。可以将电子质保单存储在多个可靠的存储设备中，并设置复杂的密码进行加密保护。同时，定期对存储设备进行维护和检查，确保其正常运行。
3. 保留必要的纸质版：在某些特殊情况下，如涉及重要工程、关键部位或者法律纠纷等，建议保留必要的纸质版质保单作为备份。这样可以增加质保单的证明力，降低法律风险。

如果你在工程质保单保留形式方面还有其他疑问或者需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。