当员工申请工伤后，公司需要承担的费用主要包括以下几个方面：
一、治疗及康复阶段费用
医疗费用：
- 这包括挂号费、诊疗费、住院费、药费等与工伤直接相关的医疗支出。如果公司已经依法为员工缴纳了工伤保险，那么这些费用将由工伤保险基金支付。但如果公司未缴纳工伤保险，则全部费用需由公司承担。
康复性治疗费用：
- 如物理治疗、康复训练等，旨在帮助员工恢复身体功能的费用，同样根据工伤保险的缴纳情况，由工伤保险基金或公司承担。
辅助器具费用：
- 因工伤导致残疾，需要配置假肢、轮椅、矫形器等辅助器具的费用，也需根据工伤保险的缴纳情况来确定支付方。
停工留薪期工资福利待遇：
- 在停工留薪期内（一般不超过12个月，特殊情况下可延长至24个月，但须经市级劳动能力鉴定委员会确认），员工原工资福利待遇不变，由公司按月支付。这是为了保障员工在暂停工作接受医疗期间的基本生活不受影响。
护理费：
- 若工伤职工需要护理，公司应负责安排或支付护理费。在评定伤残等级后并确认需要生活护理的，护理费可能从工伤保险基金按月支付（公司已缴纳工伤保险）；否则，由公司支付。
二、伤残相关费用
一次性伤残补助金：
- 根据伤残等级，由公司或工伤保险基金支付一次性伤残补助金。具体标准依据《工伤保险条例》执行，例如，七级伤残为13个月的本人工资，八级伤残为11个月的本人工资，以此类推。若公司未缴纳工伤保险，则由公司全额支付。
伤残津贴：
- 对于一至四级伤残的员工，按月支付伤残津贴，标准为本人工资的90%至75%不等（由工伤保险基金支付，公司已缴纳）。五至六级伤残的员工，若难以安排工作，也由公司按月发给伤残津贴，标准为本人工资的70%至60%。
一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金：
- 对于五至十级伤残的员工，在解除或终止劳动合同时，由工伤保险基金支付一次性工伤医疗补助金，由公司支付一次性伤残就业补助金。具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定。
三、工亡相关费用（如适用）
如果员工因工死亡，其近亲属可以领取以下费用：
丧葬补助金：
供养亲属抚恤金：
- 按照职工本人工资的一定比例发给由因工死亡职工生前提供主要生活来源、无劳动能力的亲属。标准为配偶每月40%，其他亲属每人每月30%，孤寡老人或孤儿在上述基础上增加10%。核定的各供养亲属的抚恤金之和不应高于因工死亡职工生前的工资。
一次性工亡补助金：
- 标准为上一年度全国城镇居民人均可支配收入的20倍。
四、其他费用
伙食补助费：
- 工伤职工住院期间的伙食补助费，标准由统筹地区人民政府规定。若公司购买了工伤保险，可能由工伤保险基金支付；否则，由公司承担。
交通食宿费：
- 经医疗机构出具证明，报经办机构同意，工伤职工到统筹地区以外就医所需的交通、食宿费用，从工伤保险基金支付（公司已缴纳工伤保险）。若未缴纳，则由公司承担。
劳动能力鉴定费：
- 进行劳动能力鉴定所需的费用，一般由工伤保险基金支付（公司已缴纳工伤保险）。若未缴纳，则可能由公司承担。
总结与建议：
公司在工伤情形下需承担的费用复杂多样，具体责任根据公司的工伤保险缴纳情况及当地政策确定。为了减轻潜在的经济负担和法律风险，建议公司严格遵守工伤保险法律法规，及时为职工缴纳工伤保险。如果公司在工伤处理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供详细的法律建议和指导。