结论前置：无论员工是否正常办理离职手续，只要其为公司提供了实际劳动，公司均有义务正常发放工资。非正常离职不能成为公司拒付工资的合法理由。
详细分析：
工资支付的基本原则：
- 工资是劳动者付出劳动后应得的报酬，这一原则不受劳动者离职方式的影响。只要员工为公司提供了实际劳动，无论其是否按照公司规定的流程离职，公司都有义务按照双方约定的工资标准、支付周期等支付工资。例如，员工可能因紧急情况未提前通知公司而离职，但只要其在此前为公司提供了劳动，公司就应支付相应工资。
非正常离职与工资支付的关系：
- 非正常离职，如未按照公司规定办理离职手续、未提前通知公司等，并不能成为公司拒绝支付工资的合法理由。即使公司有此类内部规定，也不得违反法律、法规的强制性规定。因为工资支付是劳动者的基本权利，公司无权以非正常离职为由剥夺这一权利。
经济损失的赔偿与处理：
- 如果员工非正常离职确实给公司造成了经济损失，公司有权要求员工赔偿。但此权利需基于两个前提：一是公司能够证明损失的存在；二是能够证明损失与员工离职行为之间存在直接的因果关系。例如，员工离职前未交接工作导致公司项目延误，公司可以要求员工赔偿因此产生的额外费用。
- 在扣除工资作为赔偿时，公司需遵守法律规定，一般每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。这是为了保护劳动者的基本生活需求，防止公司过度扣除工资。
公司的应对措施与劳动者的维权途径：
- 若公司以员工非正常离职为由拒绝支付工资，员工首先可以尝试与公司进行沟通协商，要求其支付工资。这是最直接、最快捷的解决方式。
- 协商不成的情况下，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令公司支付工资。劳动监察部门具有行政执法权，可以对公司进行处罚并强制其支付工资。
- 员工还可以选择向劳动仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。仲裁裁决具有法律效力，如果公司不执行，员工还可以申请法院强制执行。
法律建议：
- 对于公司而言，应完善内部管理制度，明确离职流程和责任划分，以减少因非正常离职带来的经济损失。同时，在扣除员工工资作为赔偿时，应严格遵守法律规定，避免过度扣除。
- 对于员工而言，应了解自己的权益和维权途径，在遭遇公司拒付工资时，及时采取措施维护自己的合法权益。同时，在离职时也应尽量按照公司规定办理离职手续，以减少不必要的纠纷。
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