结论前置：有棋牌室营业执照并不意味着法人一定不会因违法行为被抓进去，是否会被抓取决于具体的违法行为性质、情节严重程度以及相关法律法规的规定。

详细分析：

1. 合法经营与违法行为的界限：

   • 拥有棋牌室营业执照，表明该棋牌室在工商行政管理部门进行了合法注册，具备开展棋牌室经营活动的资格。
   • 然而，合法经营并不等同于可以无视法律法规进行任何活动。如果棋牌室在经营过程中存在违法行为，如赌博、提供赌博场所、容留他人吸毒等，那么法人（即棋牌室的经营者或负责人）就可能面临法律责任。

2. 违法行为的法律后果：

   • 根据违法行为的性质和情节严重程度，法人可能面临行政处罚（如罚款、吊销营业执照等）或刑事处罚（如有期徒刑、拘役等）。
   • 特别是如果棋牌室被用作赌博场所，且情节严重，那么法人可能构成开设赌场罪，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，将面临严厉的刑事处罚。

3. 具体案例与法律适用：

   • 在实际案例中，如果棋牌室被查实存在赌博等违法行为，且法人明知或应知该违法行为而未采取有效措施制止，那么法人很可能被认定为共同犯罪或单独犯罪，从而承担相应的法律责任。
   • 此外，即使法人本身没有直接参与违法行为，但如果其疏于管理、放任违法行为发生，也可能因管理失职而承担一定的法律责任。

4. 法律建议与风险防范：

   • 作为棋牌室的法人，应严格遵守国家法律法规，确保棋牌室的合法经营。
   • 加强对棋牌室的管理和监督，防止违法行为的发生。一旦发现违法行为，应立即采取措施制止并报告相关部门。
   • 定期对员工进行法律法规培训，提高员工的法律意识和合规意识。

总结与进一步思考：

拥有棋牌室营业执照并不意味着法人可以高枕无忧。在经营过程中，法人必须严格遵守国家法律法规，确保棋牌室的合法经营。一旦发现违法行为，应立即采取措施制止并报告相关部门，以避免可能的法律责任。如果您在棋牌室经营过程中遇到任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。