女员工怀孕前三个月被停职，这一行为是否合法，需分情况讨论：

1. 若停职基于合法合理的理由，且程序正当：

   • 例如，女员工因怀孕期间出现严重健康问题，医生建议休息，或者女员工本人因身体原因主动申请停职休息，且这一停职决定经过了公司内部的合法程序，如经过工会或职工代表大会的同意，并符合相关法律法规的规定，那么这种停职行为是合法的。
   • 法律依据：虽然直接的法律条文可能并未明确提及“怀孕前三个月可以停职”，但根据《劳动法》和《女职工劳动保护特别规定》的精神，女职工在孕期、产期、哺乳期内的特殊保护应得到尊重。若停职是出于对女职工身体健康的考虑，且符合相关程序，可视为合法。

2. 若停职缺乏合法合理的理由，或程序不当：

   • 如果公司仅仅因为女员工怀孕而单方面决定停职，没有合理的理由，或者未经过任何合法程序，如未与女员工协商、未经过工会或职工代表大会的同意等，那么这种停职行为是违法的。
   • 法律依据：根据《劳动法》和《女职工劳动保护特别规定》，女职工在孕期、产期、哺乳期内，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳降低其工资、予以辞退、与其解除劳动或者聘用合同。停职若未遵循这些规定，即构成违法。
   • 法律后果：女员工有权向劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼，要求公司恢复其工作，并可能获得相应的赔偿。

额外建议：

• 对于女员工而言，如果遭遇此类情况，应首先与公司进行沟通，了解停职的具体原因和依据。
• 如果沟通无果，或者认为公司的行为违法，可以及时向当地的劳动监察部门投诉，或者寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。
• 同时，女员工在孕期应特别注意保留相关证据，如医疗证明、公司通知、沟通记录等，以便在需要时提供证明。

总结：女员工怀孕前三个月被停职是否合法，取决于停职的理由和程序。若出于合法合理的健康考虑且程序正当，则合法；若缺乏合法理由或程序不当，则违法。女员工应了解自己的权益，并在必要时采取法律措施维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。