在请求行政机关退还土地预申请保证金时，适格被申请人通常为收取该保证金的行政机关。以下是对此问题的详细分析：

1. 保证金收取主体：

   • 土地预申请保证金一般由负责土地出让或管理的行政机关收取，如国土资源部门、土地储备中心等。这些机关在土地出让过程中，为了确保申请人有诚意参与竞买并遵守相关规定，会要求申请人缴纳一定数额的保证金。

2. 适格被申请人的确定：

   • 适格被申请人是指与申请人存在法律关系，且应当承担相应法律责任的主体。在请求退还土地预申请保证金的情境中，适格被申请人即为收取该保证金的行政机关。
   • 申请人应明确保证金的具体收取机关，并以其为被申请人提出退还申请。如果保证金是通过第三方机构（如银行）代为收取的，但实际法律关系仍存在于申请人与行政机关之间，因此适格被申请人仍为行政机关。

3. 法律依据与程序：

   • 申请人请求退还保证金时，应依据相关法律法规和合同约定，向收取保证金的行政机关提出书面申请，并附上相关证明材料。
   • 行政机关在收到申请后，应依法进行审查，并在规定期限内作出是否退还的决定。如果行政机关拒绝退还或未在规定期限内作出决定，申请人可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。

4. 特殊情况处理：

   • 如果存在多个行政机关参与土地出让过程，且保证金收取责任不明确的情况，申请人可能需要通过法律途径（如行政诉讼）来确定适格被申请人。
   • 在某些情况下，如果保证金被错误收取或存在其他争议，申请人也可以考虑通过协商、调解等非诉讼方式解决争议。

建议：在处理此类问题时，申请人应首先明确保证金的收取机关，并收集相关证据材料。如果遇到复杂情况或争议，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。