针对公司管理者因员工借款问题遭受短信轰炸的情况，可采取以下法律措施进行应对：

1. 固定证据：

   • 保存短信记录：确保所有轰炸短信均被完整保存，包括发送时间、发送号码、短信内容等，这些将作为后续维权的关键证据。
   • 记录其他证据：如有可能，记录下短信轰炸的频率、持续时间，以及是否对工作、生活造成了实际影响，如精神损害、工作干扰等。

2. 报警处理：

   • 向公安机关报案：根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，多次发送淫秽、侮辱、恐吓或者其他信息，干扰他人正常生活的，处五日以下拘留或者五百元以下罚款；情节较重的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款。短信轰炸行为若构成骚扰，可依法向公安机关报案。
   • 提供证据：在报案时，向公安机关提供已固定的证据，以便其进行调查处理。

3. 民事诉讼：

   • 提起侵权诉讼：若短信轰炸行为对管理者的名誉权、隐私权等造成了损害，可依据《中华人民共和国民法典》中关于人格权保护的规定，向法院提起民事诉讼，要求侵权者停止侵害、赔礼道歉、赔偿损失等。
   • 申请行为保全：在诉讼过程中，若认为短信轰炸行为可能继续或加剧损害，可向法院申请行为保全，要求侵权者立即停止发送骚扰短信。

4. 联系运营商协助：

   • 向运营商投诉：将遭受短信轰炸的情况向手机运营商反映，要求其采取技术手段拦截骚扰短信，或提供发送者的相关信息（在合法合规的前提下）。
   • 配合调查：若运营商需要管理者配合调查，应积极提供所需信息，以便运营商更好地协助解决问题。

5. 加强个人信息安全保护：

   • 更换联系方式：若情况严重，可考虑更换手机号码，以避免继续遭受骚扰。
   • 提高警惕：在日常工作中，注意保护个人信息安全，避免将个人联系方式随意泄露给不必要的人员或机构。

针对员工借款问题本身，若员工借款行为涉嫌违法或违约，公司管理者还可考虑通过法律途径追讨借款，如提起民事诉讼或申请仲裁等。但这一步骤与应对短信轰炸是独立的，需根据具体情况分别处理。

若您在处理此类问题时遇到任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。