员工因个人贷款问题遭受电话短信骚扰，可采取以下法律措施维护自身权益：

1. 明确骚扰行为的法律性质
   根据《民法典》第1032-1033条，自然人享有隐私权，任何组织或个人不得以电话、短信等方式侵扰他人私人生活安宁。若贷款公司或第三方催收机构频繁拨打员工私人电话、发送威胁性短信，甚至在非工作时间骚扰，可能构成对隐私权的侵犯，需承担停止侵害、赔礼道歉、赔偿损失等民事责任。

2. 分情况处理骚扰行为

   • 若骚扰来自正规金融机构：
     根据《商业银行信用卡业务监督管理办法》第68条，催收人员不得骚扰债务人亲属或与债务无关的第三人。员工可要求对方提供贷款合同编号、欠款明细等证明材料，若对方无法提供或继续骚扰，可向金融机构客服投诉，并保留通话记录、短信截图等证据。
     
   • 若骚扰来自非法贷款公司或第三方催收：
     若对方存在威胁、辱骂、泄露个人信息等行为，可能涉嫌违反《治安管理处罚法》第42条（公然侮辱他人或捏造事实诽谤他人，处5日以下拘留或500元以下罚款；情节较重的，处5-10日拘留，可并处500元以下罚款）。员工可直接向公安机关报案，要求立案查处。

3. 具体应对步骤

   • 收集证据：保存所有骚扰电话记录、短信内容、录音（如有）及对方联系方式，记录骚扰时间、频率和具体内容。
     
   • 正式警告：通过书面形式（如邮件、短信）要求对方停止骚扰，明确告知其行为已违法，并保留送达证据。
     
   • 投诉举报：
     
     • 向贷款公司所属地的银保监会（针对正规金融机构）或地方金融监管局投诉；
       
     • 通过“中国互联网金融协会”官网举报非法贷款平台；
       
     • 若涉及个人信息泄露，可向网信办举报。
       
   • 法律诉讼：若骚扰持续且造成严重精神损害，可依据《民法典》第1183条提起侵权诉讼，主张精神损害赔偿。

4. 预防性措施

   • 更换手机号码或设置骚扰拦截功能（如开启手机“高频骚扰防护”）；
     
   • 向运营商申请“谢绝来电”服务；
     
   • 避免在公开平台随意留存个人联系方式，谨慎处理贷款相关事务。

提示：若骚扰行为已影响正常生活，建议优先通过报警或投诉快速制止侵权行为，再通过法律途径追究责任。如有具体证据或需要进一步分析，可随时向我提供细节，我会协助制定更精准的应对方案。