结论：您有权起诉要求对方拆除卧室上方的卫生间，即使对方声称不再使用，若未拆除仍可能构成违法，您可通过法律途径维护自身权益。以下从法律角度为您详细分析：
一、法律背景与依据
相邻权保护：
- 根据《民法典》第二百八十八条：“不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。”卧室作为居住空间，其上方被改建为卫生间，可能影响您的居住环境和生活质量，违反了相邻权中的“方便生活”原则。
建筑物区分所有权：
- 若您与对方属于同一建筑物的不同业主，根据《民法典》第二百七十二条：“业主对其建筑物专有部分享有占有、使用、收益和处分的权利。业主行使权利不得危及建筑物的安全，不得损害其他业主的合法权益。”对方将卧室上方改建为卫生间，可能危及建筑物的结构安全，并损害您的合法权益。
规划与建设法规：
- 改建卫生间可能涉及建筑结构的改动，需符合相关规划与建设法规。若未经相关部门批准擅自改建，可能构成违法建设，您有权向相关部门举报，并要求对方恢复原状。
二、对方不拆除卫生间的合法性分析
不拆除不等于合法：
- 对方声称不再使用卫生间，但并未拆除，这并不意味着其行为合法。只要改建行为本身违反了相关法律法规或损害了您的合法权益，您就有权要求对方拆除。
潜在危害持续存在：
- 即使卫生间不再使用，其改建行为可能已对建筑物的结构造成损害，或存在漏水、异味等潜在危害，这些危害可能持续影响您的居住环境。
三、您的法律救济途径
协商与调解：
- 首先，您可以尝试与对方进行协商，要求其拆除卫生间并恢复原状。若协商无果，您可以寻求物业、居委会或相关部门的调解。
起诉要求拆除：
- 若协商与调解均无法解决问题，您有权向法院提起诉讼，要求对方拆除卫生间并赔偿因改建行为给您造成的损失。在诉讼过程中，您需要提供相关证据证明对方的行为违反了相关法律法规或损害了您的合法权益。
举报违法建设：
- 同时，您还可以向当地规划、建设或城管等部门举报对方的违法建设行为，要求相关部门进行查处并恢复原状。
四、建议与注意事项
收集证据：
- 在采取任何法律行动之前，建议您先收集相关证据，如照片、视频、证人证言等，以证明对方的行为违反了相关法律法规或损害了您的合法权益。
咨询专业律师：
- 由于法律问题具有复杂性和专业性，建议您在采取法律行动之前咨询专业律师（当然，您可以直接向我咨询），以获取更具体的法律建议和指导。
保持冷静与理性：
- 在处理此类纠纷时，请保持冷静与理性，避免采取过激行为或言语攻击对方，以免加剧矛盾并影响问题的解决。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。