结论：在一般情况下，别人借儿子的钱，还钱时把钱打到父亲的卡里，若儿子同意或事后追认，且该行为不损害他人利益，通常是可以的；但若儿子不同意或该行为损害了他人利益，则可能存在问题。以下从不同角度进行分析：
一、合同相对性原则
从合同法的角度来看，借款合同是借款人与出借人之间达成的协议，具有相对性。这意味着，还款义务应当由借款人直接向出借人履行。在本案例中，出借人是儿子，因此，理论上借款人应当将款项直接归还给儿子。然而，如果儿子明确同意或事后追认借款人将款项打入父亲的账户，且该行为没有损害到其他人的利益，那么这种还款方式是可以被接受的。
二、实际履行与合同变更
实际履行：在实际操作中，如果借款人因特殊原因（如儿子不在场、无法联系等）而将款项打入父亲的账户，且儿子事后得知并表示接受，这可以视为借款人已经履行了还款义务。但为了避免纠纷，建议借款人在还款时尽量与出借人（儿子）直接沟通，并确保款项确实到达了出借人的账户。
合同变更：如果儿子希望借款人将款项打入父亲的账户，并且双方就此达成了新的协议或补充协议，那么这可以视为对原借款合同的变更。在这种情况下，借款人按照新的协议履行还款义务是合法的。但务必确保这种变更不会损害到其他人的利益，并且最好以书面形式记录下来，以便在发生纠纷时作为证据。
三、可能存在的法律风险
儿子不同意：如果儿子不同意借款人将款项打入父亲的账户，而借款人仍然这样做了，那么这可能构成违约。儿子有权要求借款人重新履行还款义务，即将款项直接归还给他。
损害他人利益：如果借款人将款项打入父亲的账户的行为损害了其他人的利益（例如，父亲用这笔款项偿还了自己的债务，导致儿子无法收回借款），那么这种行为可能构成不当得利或侵权。在这种情况下，儿子有权要求父亲返还这笔款项，并可能要求借款人承担相应的法律责任。
四、建议
明确沟通：在借款和还款过程中，双方应当保持明确的沟通，确保还款方式、还款账户等关键信息得到双方的确认和同意。
书面记录：为了避免纠纷，建议双方将借款和还款的相关事宜以书面形式记录下来，包括借款金额、还款期限、还款方式等。
法律咨询：如果双方在借款和还款过程中遇到任何法律问题或纠纷，建议及时咨询专业律师，以便得到专业的法律建议和帮助。
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