要求公司按照实际发放工资缴纳社保的诉讼时效问题，需分情况讨论，核心结论如下：

1. 若以公司未足额缴纳社保为由要求补缴，一般不受普通民事诉讼时效限制
   根据《社会保险法》及《社会保险费征缴暂行条例》，社保缴费基数争议属于行政征收范畴，由社保征收机构处理。劳动者可向当地社保部门投诉，要求公司按实际工资补缴社保差额，此类投诉无时效限制。即使离职多年，只要公司未足额缴纳的事实存在，社保部门仍可依法追缴。

2. 若以公司未足额缴纳社保为由主张经济补偿，需适用劳动仲裁时效
   若劳动者以公司“未依法缴纳社会保险费”为由解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿金，则需适用《劳动争议调解仲裁法》规定的1年仲裁时效。时效从劳动者知道或应当知道权利被侵害之日起计算（例如：离职时发现公司未按实际工资缴纳社保，则从离职之日起算1年）。

3. 特殊情形：公司未缴纳社保的行政处罚时效
   若社保部门对公司未缴纳社保的行为进行行政处罚（如罚款），则需遵守《行政处罚法》规定的2年追罚时效（从违法行为发生之日起算；违法行为有连续或继续状态的，从行为终了之日起算）。但此情形与劳动者个人权益无直接关联，更多涉及公司责任。

实务建议：

• 若发现公司未按实际工资缴纳社保，优先向当地社保部门投诉（如社保局、税务局），要求补缴差额，此途径无需担心时效问题。
  
• 若计划通过劳动仲裁主张经济补偿，需在离职后1年内提出申请，并准备工资流水、社保缴费记录等证据证明公司未足额缴纳。
  
• 社保问题涉及行政、劳动双重法律关系，建议根据具体诉求选择合适途径，必要时可进一步向我咨询具体操作流程。