起诉他人伪造假的毕业证后撤诉，被告人是否会被处罚，需分情况讨论：

1. 撤诉的法律效果

   • 撤诉是原告在诉讼过程中，主动向法院申请撤回起诉的行为。一旦法院裁定准许撤诉，诉讼程序即告终结，原被告之间的诉讼法律关系随之消灭。这意味着，从诉讼程序的角度看，被告人不再面临被法院判决有罪或无罪的风险。

2. 撤诉不影响刑事责任的独立追究

   • 伪造毕业证的行为，若构成犯罪，其刑事责任是独立于诉讼程序的。根据《中华人民共和国刑法》第二百八十条的规定，伪造公司、企业、事业单位、人民团体的印章的，构成犯罪，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金。学历证书上通常盖有颁发机构的印章，因此伪造学历证书也涉及伪造印章的行为，可能构成犯罪。
   • 撤诉只是原告放弃了通过诉讼程序追究被告人责任的权利，但并不意味着被告人的行为就因此变得合法或不受法律制裁。如果被告人的行为确实构成了犯罪，且公安机关或检察机关已经掌握了相关证据，那么即使原告撤诉，被告人仍可能面临刑事责任的追究。

3. 撤诉后被告人可能面临的法律后果

   • 刑事责任：如前所述，如果被告人的行为构成犯罪，且公安机关或检察机关已经介入调查，那么撤诉后被告人仍可能面临刑事责任的追究。这包括被逮捕、起诉、审判以及可能的刑罚执行。
   • 行政责任：即使被告人的行为不构成犯罪，但如果违反了相关行政法规或规章，如《中华人民共和国治安管理处罚法》等，那么撤诉后被告人仍可能面临行政处罚，如罚款、拘留等。
   • 民事责任：如果被告人的行为给原告造成了损失，且原告在撤诉前已经提出了民事赔偿请求，那么撤诉后原告仍可以通过其他途径（如另行起诉）来追究被告人的民事责任。不过，需要注意的是，撤诉通常意味着原告放弃了在当前诉讼中追究被告人民事责任的权利，因此原告需要谨慎考虑撤诉的后果。

4. 特殊情况下的处理

   • 在某些情况下，原告撤诉可能是出于与被告达成和解、被告已经履行了相关义务或原告认为继续诉讼已无必要等原因。在这些情况下，如果被告人已经采取了积极措施来纠正自己的错误行为或赔偿原告的损失，那么被告人可能面临较轻的法律后果或甚至免于处罚。但这并不意味着被告人的行为就因此变得合法或不受任何制裁，而是基于法律上的宽严相济原则或实际处理中的灵活性考虑。

总结与建议：

• 起诉他人伪造假的毕业证后撤诉，并不意味着被告人就因此免于处罚。被告人的行为是否构成犯罪以及是否应受到处罚，取决于其行为本身的性质、情节以及相关法律法规的规定。
• 如果您作为原告或相关方，在撤诉后仍对被告人的行为有疑虑或担忧，建议及时向公安机关或检察机关报案或举报，以便相关部门能够依法进行调查和处理。
• 如果您有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。