员工私自收取顾客6000元后跑路的行为，属于违法行为，可能同时涉及民事侵权和刑事犯罪，具体处理方式需结合实际情况判断。以下分情况详细说明：

一、民事侵权角度：员工行为构成职务侵占或不当得利，商家需承担连带责任后追偿

1. 法律关系分析
   根据《民法典》第1191条，员工在执行工作任务时造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任；用人单位承担责任后，可向有故意或重大过失的员工追偿。

   • 若员工以商家名义收款（如使用商家收款码、工牌等），顾客有理由相信其代表商家，商家需先向顾客退还6000元，再向员工追偿；
     
   • 若员工伪造身份或私自收款（如使用个人二维码），且顾客明知对方非商家代表，则商家无需承担责任，员工直接构成不当得利，需返还钱款。

2. 处理建议

   • 立即联系顾客：核实收款细节（时间、方式、是否承诺服务），留存聊天记录、转账凭证等证据；
     
   • 内部处理：若员工仍在职，要求其立即退还钱款；若已离职，通过书面催告函要求限期返还；
     
   • 诉讼追偿：若员工拒不返还，可向法院起诉，主张返还钱款并赔偿损失（如诉讼费、律师费等）。

二、刑事犯罪角度：员工可能涉嫌职务侵占罪或诈骗罪

1. 职务侵占罪（《刑法》第271条）

   • 构成要件：员工利用职务便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大（6万元以上为“数额较大”，但部分地区3万元即可立案）。
     
   • 本案适用性：若员工收取的6000元属于商家应收款项（如预付款、货款），且员工利用职务便利（如收银员、销售员），可能构成职务侵占罪。但6000元未达刑事立案标准，商家可向公安机关报案，要求行政处罚（如拘留、罚款），或通过民事途径解决。

2. 诈骗罪（《刑法》第266条）

   • 构成要件：以非法占有为目的，虚构事实或隐瞒真相，骗取他人财物，数额较大（3000元至1万元以上）。
     
   • 本案适用性：若员工虚构身份（如冒充商家老板）、承诺服务（如“充值送礼品”）后跑路，可能构成诈骗罪。6000元已达刑事立案标准，商家可立即向公安机关报案，要求追究刑事责任。

3. 处理建议

   • 收集证据：包括员工身份信息、收款记录、聊天记录、监控录像等，证明其主观故意和客观行为；
     
   • 报案处理：向员工户籍地或实际居住地公安机关报案，提交证据材料，要求立案侦查；
     
   • 配合调查：协助警方抓捕员工，追缴赃款，尽可能减少损失。

三、商家风险防范建议

1. 完善财务制度：禁止员工私自收款，所有交易通过商家对公账户或指定收款码完成；
   
2. 加强员工管理：定期培训法律风险，签订《廉洁承诺书》，明确违规后果；
   
3. 购买雇主责任险：转移因员工侵权导致的经济损失风险。

如有进一步疑问（如证据收集、报案流程等），可直接向我咨询，我会结合具体细节为您提供详细方案。