总包方在工程过程中发现质量不合格，应当及时采取措施进行整改，并通知相关方，以确保工程质量符合合同约定和标准要求。具体分析如下：

一. 总包方的责任与义务

1. 质量检查与整改：根据《建设工程质量管理条例》第三十条，施工单位应当建立质量责任制，对建设工程的施工质量负责。总包方作为施工单位，有责任对工程质量进行检查，并在发现质量不合格时及时进行整改。
2. 通知义务：总包方在发现质量不合格后，应及时通知建设单位（业主）和监理单位，说明质量不合格的情况及整改措施，以便各方共同协调解决。

二. 整改措施的实施

1. 制定整改方案：总包方应针对质量不合格的情况，制定详细的整改方案，包括整改措施、整改期限、整改责任人等。
2. 实施整改：按照整改方案，总包方应组织力量进行整改，确保整改措施得到有效实施。
3. 复检与验收：整改完成后，总包方应组织复检，并邀请建设单位和监理单位进行验收，确保整改后的工程质量符合合同约定和标准要求。

三. 法律后果与风险防范

1. 法律责任：如果总包方未及时发现或整改质量不合格，导致工程质量问题，总包方可能需要承担相应的法律责任，包括赔偿损失、修复费用等。
2. 风险防范：为防范质量风险，总包方应加强质量管理，建立健全质量管理体系，定期进行质量检查和评估，确保工程质量符合合同约定和标准要求。

我建议：总包方在发现工程质量不合格时，应积极主动采取措施进行整改，并与建设单位和监理单位保持沟通，共同协调解决质量问题。同时，总包方还应加强质量管理，提高工程质量意识，确保工程质量符合合同约定和标准要求。如有进一步需要，您可以继续咨询我。