结论前置：申请休年假未批准，没来上班是否算旷工，需结合具体情况及公司规章制度来判断。一般情况下，若员工未按制度规定申请或未经有效批准而擅自缺勤，会被认定为旷工；但在特殊情况下，如遭遇不可抗力或紧急且合理的事由，即使请假未获批准，也不应被认定为旷工。
详细分析：
一般情况下的旷工认定：
- 公司规章制度：若公司规章制度中明确规定了年假的申请流程、审批权限及未获批擅自缺勤的后果，且该制度合法合理，那么员工在未获批年假的情况下擅自不来上班，很可能被认定为旷工。
- 员工行为：员工在申请年假时，应严格按照公司规定的流程进行，如提前提交书面申请、提供必要证明等。若员工未遵循这些流程，或未经有效批准而擅自缺勤，公司有权依据规章制度进行相应处理，如记录旷工、扣除工资等。
特殊情况下的非旷工认定：
- 不可抗力因素：若员工因突发疾病、自然灾害等不可抗力因素无法按时上班，并能及时向公司说明情况并提供相应证明（如医院急诊病历、政府部门灾害预警等），则即使年假申请未获批准，也不应被认定为旷工。
- 紧急且合理的情况：如家中突发重大变故（亲人突发急病、严重意外事故等），员工在紧急情况下无法及时履行正常请假流程，只要事后及时向公司说明真实情况并提供相关证明，一般也不应被认定为旷工。
公司规章制度的合法性与合理性：
- 合法性：公司的规章制度必须通过民主程序制定并公示，内容不得违反法律法规。若制度中规定“未经批准的年假缺勤视为旷工”，且该条款合法合理，则公司可以据此对员工进行相应处理。
- 合理性：公司在制定规章制度时，应充分考虑员工的实际情况和合理需求，避免过于严苛或不合理。例如，对于紧急情况的请假，公司可以设置更为灵活的处理机制，以体现人性化管理。
法律建议：
员工端：
- 在申请年假前，仔细查阅公司员工手册或相关规章制度，了解年假申请流程和特殊情况处理机制。
- 严格按照公司规定的流程申请年假，并确保自己符合休年假的条件。
- 如遇特殊情况无法按时上班，及时向公司说明情况并提供相应证明，以避免被认定为旷工。
公司端：
- 完善年假申请和审批制度，明确流程、权限及后果，确保制度合法合理。
- 在处理员工年假申请时，充分考虑员工的实际情况和合理需求，避免过于严苛或不合理。
- 加强与员工的沟通，对拒绝年假申请的理由进行书面说明，避免主观随意性。
可能后果：
- 若员工被认定为旷工，公司可能依据规章制度进行相应处理，如记录旷工、扣除工资、甚至解除劳动合同等。
- 若员工认为公司的处理决定不合理或违法，可以通过劳动争议调解仲裁机构或人民法院进行维权。
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