在不知情的情况下租了科研用地开餐饮店，您可能面临合同效力、行政处罚以及民事赔偿等多方面的问题，以下为您详细分析：
一、合同效力问题
合同可能无效：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，科研用地属于特殊用途土地，其使用需严格遵循规划用途，不得擅自改变土地用途。若租赁合同中明确约定了土地用途为科研，而您却用于开餐饮店，这违反了法律法规的强制性规定，因此，该租赁合同可能因违反法律强制性规定而被认定为无效。
合同无效的后果：
- 若合同被认定为无效，您可能无法继续在该土地上经营餐饮店，且可能面临返还土地、赔偿损失等法律责任。同时，您已支付的租金等费用也可能难以全额追回，具体需根据双方过错程度及实际情况进行分担。
二、行政处罚问题
可能面临的处罚：
- 由于您擅自改变了土地用途，可能面临国土资源部门的行政处罚，包括但不限于罚款、责令限期改正、没收违法所得等。处罚的严重程度将取决于您违法行为的性质、情节以及造成的后果等因素。
应对建议：
- 在收到行政处罚决定后，您应认真审查处罚决定的合法性和合理性。若认为处罚决定存在错误或不当之处，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
三、民事赔偿问题
可能涉及的赔偿：
- 若因您的违法行为给出租方或其他第三方造成损失的，您可能需要承担相应的民事赔偿责任。这包括但不限于因土地用途改变导致的土地价值减损、因经营餐饮店产生的环境污染治理费用等。
赔偿原则：
- 在确定赔偿金额时，将遵循“过错责任原则”，即根据您在违法行为中的过错程度来确定赔偿比例。若您能够证明自己是在不知情的情况下租赁了该土地，且已尽到了合理的审查义务，那么您的赔偿责任可能会相应减轻。
四、建议措施
立即停止违法行为：
- 在发现租赁土地用途与合同约定不符后，您应立即停止在该土地上经营餐饮店，并尽快与出租方协商解决方案，以避免损失进一步扩大。
咨询专业律师：
- 鉴于此类问题的复杂性，建议您尽快咨询专业律师，以便更全面地了解自己的法律权益和义务，并制定合适的应对策略。作为专业律师，我可以为您提供详细的法律咨询和代理服务，帮助您妥善处理此事。
积极配合相关部门调查：
- 在国土资源部门等行政机关进行调查时，您应积极配合，如实提供相关证据和信息，以便行政机关能够准确了解事实情况，并作出公正的处理决定。
总之，在不知情的情况下租了科研用地开餐饮店是一个复杂且敏感的问题，涉及合同效力、行政处罚以及民事赔偿等多个方面。建议您尽快采取措施，咨询专业律师，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。