反诉方鉴定失败，法院的判决需根据具体情形来综合判定，通常有以下几种处理方式：

1. 鉴定程序违法或鉴定机构不具备资质，鉴定意见被排除
   若反诉方申请的鉴定因程序严重违法（如未通知对方到场、未封存检材等），或鉴定机构/鉴定人不具备法定资质，导致鉴定意见被法院依法排除，此时反诉方可能因缺乏关键证据而承担不利后果。例如，反诉方主张对方产品存在质量问题并申请质量鉴定，但鉴定机构未按照国家标准检测，法院可能不采信该鉴定意见，反诉方需自行承担举证不能的风险，反诉请求可能被驳回。

2. 鉴定意见存在瑕疵但未被完全排除，法院结合其他证据综合判断
   若鉴定意见存在程序瑕疵（如检材保存不当但未影响核心结论）或内容争议（如鉴定方法存在不同观点），但未达到“严重违法”或“明显依据不足”的程度，法院可能不会直接排除该意见，而是结合其他证据（如双方交易记录、证人证言、行业惯例等）综合认定事实。例如，反诉方申请的工程造价鉴定因部分项目漏算被对方质疑，但法院审查后认为漏算部分占比小且不影响总价合理性，可能仍采信鉴定意见并支持反诉方部分诉求。

3. 反诉方因鉴定失败主动撤诉或法院驳回反诉请求
   若鉴定失败导致反诉方无法证明其主张（如无法证明对方违约、侵权或损失金额），反诉方可能选择主动撤回反诉，法院经审查后裁定准许；若反诉方坚持诉讼但未提供其他有效证据，法院可能以“证据不足”为由直接驳回反诉请求。例如，反诉方主张对方侵犯其专利权并申请技术鉴定，但鉴定机构因技术限制无法明确侵权成立，反诉方又无其他证据，法院可能驳回反诉。

4. 法院依职权启动补充鉴定或重新鉴定
   若鉴定失败系因客观原因（如检材灭失、技术条件限制）或鉴定机构过错（如超范围鉴定），且案件事实认定需依赖鉴定结论，法院可能依职权委托其他机构补充鉴定或重新鉴定。例如，反诉方申请的医疗损害鉴定因病历缺失关键页无法进行，法院可能要求医疗机构补充病历后重新委托鉴定，最终根据新鉴定意见判决。

温馨提示：鉴定失败对反诉方的影响需结合具体案情判断，关键在于鉴定意见是否被法院采信以及反诉方能否提供其他证据补强。若您遇到此类问题，可直接向我说明案件细节（如鉴定类型、争议焦点、现有证据等），我会为您进一步分析判决走向及应对策略。