关于您提出的“公司加班费基数按当地最低工资标准是否合法”的问题，我可以明确地告诉您，这种做法是不合法的。下面我将从几个方面为您详细解释：

首先，我们需要明确最低工资标准的定义与意义。最低工资标准是劳动者在法定工作时间或依法签订的劳动合同约定的工作时间内提供了正常劳动的前提下，用人单位依法应支付的最低劳动报酬。这一标准旨在保障劳动者的基本生活需求，确保他们能够获得与其劳动相匹配的报酬。

接下来，我们来看加班费基数的确定原则。加班费基数通常应当以劳动者正常工作时间工资为计算基数。这意味着，在计算加班费用时，应以劳动者在正常工作时间内的工资作为起点，而不是随意降低到最低工资标准。如果劳动合同中有明确约定工资结构，并且该结构中的基本工资部分不低于最低工资标准，同时约定以基本工资作为加班费计算基数，这种约定在不违反法律强制性规定和公平合理原则的情况下，才有可能得到认可。但无论如何，加班费基数都不能低于当地最低工资标准。

再来看法律法规的明确规定。根据《劳动法》及相关法律法规，用人单位安排劳动者加班的，必须按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%、200%、300%支付不同时段加班的工资。这些加班工资的计算基数不得低于当地最低工资标准，这是法律的硬性要求。如果用人单位违反这一规定，将面临法律责任。

那么，如果劳动者发现用人单位确定的加班费基数低于最低工资标准，应该怎么办呢？首先，劳动者可以尝试与用人单位进行协商解决，要求其按照正确的计算基数支付加班费。如果协商不成，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。

最后，我想提醒您，在实际操作中，劳动者应仔细审查自己的劳动合同，确保其中关于工资和加班费计算的条款符合法律法规的要求。同时，也要保留好相关证据，如工资条、加班记录等，以便在需要时提供证明。

综上所述，公司加班费基数按当地最低工资标准是不合法的行为。劳动者应了解自己的权利，并在必要时采取法律手段来维护自己的利益。同时，用人单位也应严格遵守相关法律法规，确保劳动者的合法权益得到充分保障。