在处理肇事方已垫付医药费后的赔偿问题时，我们需要综合考虑多个方面，以确保您的合法权益得到充分保障。以下是一个详细且有条理的处理指南：
一、保留关键证据
首先，您需要严格保存所有与垫付医药费相关的证据，这是后续索赔的基础。具体包括：
- 票据类证据：如医院的收费发票、费用清单等，这些是证明您实际支付金额的直接依据。
- 沟通记录：保留与事故对方就垫付事宜的沟通记录，如微信、短信聊天记录或电话录音，以证明垫付行为是双方知晓且认可的。
- 支付凭证：无论是现金、银行卡转账还是第三方支付平台（如微信支付、支付宝）支付的垫付款，都应留存相应的支付凭证。若为现金支付，务必要求对方出具收条。
- 医疗文件：拍摄伤者的诊断证明、检查报告等相关医疗文件，以便更全面地了解伤情和治疗情况。
二、明确责任划分
交通事故发生后，交警部门会出具交通事故责任认定书，明确各方在事故中的责任比例。这一责任划分对于后续医药费的承担至关重要。您需要根据责任认定书来确定自己应承担的责任比例，以及对方应承担的比例。
三、赔偿流程与具体操作
与保险公司协商理赔：
- 如果您或对方车辆投保了交强险和商业三者险，应及时向保险公司报案，并告知垫付医药费的情况。
- 按照保险公司的要求整理并提交理赔材料，包括交通事故责任认定书、垫付医药费的票据、病历、诊断证明等。
- 保险公司审核通过后，会根据保险合同的约定进行赔付。若垫付费用在保险赔偿范围内，保险公司将支付相应款项。
与对方协商处理：
- 根据事故责任划分，与事故对方就垫付的医药费进行协商，要求其按照责任比例承担相应的费用。
- 双方可签订书面协议，明确垫付的金额、支付方式及后续处理方式，以确保权益得到保障。
- 如协商不成，可请求交警部门进行调解，促使达成赔偿协议。
通过法律途径解决：
- 若与对方协商无果，且对方拖延支付垫付的医药费，您可委托律师向对方发送催款函，明确告知其应承担的责任和还款期限。
- 如催款函仍无效，您可向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，提交充分证据证明自己垫付医药费的事实及事故责任划分情况。
- 法院将审理案件并作出判决，以维护您的合法权益。
四、赔偿项目与计算标准
- 赔偿项目：医药费赔偿通常包括挂号费、检查费、治疗费、药费、住院费等与治疗交通事故所受伤害直接相关的费用。
- 计算标准：医药费的计算应根据医疗机构出具的正式票据为准。对于后续治疗费用，如果医疗机构有明确的意见或建议，可以一并主张赔偿。
五、特殊情况处理与注意事项
- 医保外费用：部分医疗费用可能不在医保报销范围内，这部分费用也需要根据实际情况进行赔偿。在诉讼中，法院可能会根据具体情况酌定医保外费用的赔偿比例。
- 伤残赔偿：如果交通事故导致受害人伤残，除了医药费外，还可能涉及残疾赔偿金、精神损害抚慰金等其他赔偿项目。
- 保留证据与咨询专业律师：务必妥善保管所有与医疗费用相关的票据和清单，这是后续索赔的重要依据。在处理复杂的交通事故赔偿案件时，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见和帮助。
综上所述，处理肇事方已垫付医药费后的赔偿问题时，您应确保留存好相关证据，明确责任划分，并根据实际情况选择合适的处理方式。在与保险公司、事故对方协商或采取法律途径时，务必保持冷静和理智，以确保自身权益得到充分保障。