结论：双方口供不一致但已签谅解书的情况下，处理方式需根据具体案件情况、证据状况及法律程序来综合判断。以下是从不同角度给出的详细分析：
一、谅解书的法律性质与效力
谅解书，通常是在刑事案件中，被害人或其家属与犯罪嫌疑人或被告人之间就犯罪行为造成的损害达成的一种和解协议。它体现了被害人或其家属对犯罪嫌疑人或被告人的谅解，并可能作为量刑时的一个考虑因素。然而，谅解书并不等同于对犯罪事实的认可或放弃追究刑事责任的权利。因此，即使双方已经签署了谅解书，如果口供不一致，仍然需要依据其他证据来认定案件事实。
二、口供不一致的处理
证据审查：在刑事诉讼中，口供只是证据之一，且其证明力相对较弱。当双方口供不一致时，法院或检察机关会结合其他证据，如物证、书证、证人证言、鉴定意见等，来综合判断案件事实。如果其他证据能够形成完整的证据链，证明某一方的口供更符合事实，那么该方的口供将被采纳。
补充侦查：如果口供不一致且其他证据不足以证明案件事实，检察机关或法院可能会要求公安机关进行补充侦查，以收集更多证据来查明真相。
量刑考虑：即使口供不一致，但如果已经签署了谅解书，且谅解书真实有效，那么在量刑时，法院可能会考虑这一因素，对犯罪嫌疑人或被告人从轻或减轻处罚。但这一考虑必须建立在案件事实清楚、证据确实充分的基础上。
三、可能面临的法律后果
如果口供不一致导致案件事实无法查清：那么案件可能会因证据不足而无法起诉或判决。在这种情况下，犯罪嫌疑人或被告人可能会被释放或宣告无罪，但也可能面临进一步侦查或起诉的风险，如果后续有新证据出现。
如果口供不一致但其他证据充分：那么案件事实将被依法认定，并依据相关法律规定进行判决。谅解书可能作为量刑时的一个考虑因素，但不会改变案件的基本事实和法律定性。
如果谅解书存在瑕疵或无效：例如，谅解书是在被胁迫、欺诈等情况下签署的，那么该谅解书将被视为无效。在这种情况下，即使双方已经签署了谅解书，也不会对案件的判决产生实质性影响。
四、建议与行动
保持冷静与配合：在面对口供不一致的情况时，双方应保持冷静，积极配合司法机关的调查和审判工作。不要试图通过隐瞒、伪造证据等手段来影响案件的判决结果。
寻求法律帮助：如果双方对案件事实、法律程序或谅解书的效力等方面存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师，以获取更全面、准确的法律意见和帮助。
关注案件进展：双方应密切关注案件的进展情况，及时了解司法机关的调查和审判结果。如果对判决结果有异议，可以在法定期限内提出上诉或申诉等法律救济途径。
作为李笠律师，我擅长处理刑事辩护、行政纠纷、合同纠纷等领域的法律问题。如果您有任何相关疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。