公务员被秘密调查，其法律后果及影响需根据调查的具体情况、调查机关的权限以及调查结果来综合判断。以下从多个角度对此问题进行分析：

1. 调查机关与权限：

   • 公务员若涉嫌违法违纪，可能面临纪检监察机关、检察机关或公安机关的调查。这些机关在调查时，会依据其法定权限和程序进行，包括但不限于询问、查阅资料、调取证据等。
   • 秘密调查通常指的是在调查过程中，不公开调查对象、调查内容或调查进展，以避免干扰调查或造成不必要的社会影响。这种调查方式在符合法律规定和程序的前提下，是合法的。

2. 调查内容与目的：

   • 调查内容可能涉及公务员的职务行为、个人财产、社交关系等多个方面，旨在查明公务员是否存在违法违纪行为。
   • 调查目的通常是为了维护国家法律的尊严和权威，保障公务员队伍的廉洁性和公正性，以及保护公共利益不受侵害。

3. 法律后果：

   • 若调查未发现违法违纪行为：公务员的声誉和职业生涯可能不会受到直接影响。但秘密调查本身可能会给公务员带来一定的心理压力和困扰。
   • 若调查发现违法违纪行为：公务员可能面临纪律处分、行政处罚甚至刑事处罚。具体处罚措施将根据违法违纪行为的性质、情节和后果来决定。例如，可能面临警告、记过、降级、撤职、开除等纪律处分；若构成犯罪，还将依法追究刑事责任。

4. 对公务员权益的影响：

   • 在秘密调查期间，公务员的某些权益可能会受到一定限制，如隐私权、名誉权等。但这些限制必须在法律规定的范围内进行，且不得侵犯公务员的合法权益。
   • 若调查机关在调查过程中存在违法行为或侵犯公务员权益的行为，公务员有权依法维护自己的权益，包括向有关部门投诉、申诉或提起诉讼等。

5. 建议与应对：

   • 保持冷静与配合：若公务员得知自己正在被秘密调查，应保持冷静，积极配合调查机关的工作，如实提供相关信息和证据。
   • 了解法律程序：公务员应了解自己的法律权益和调查程序，以便在调查过程中更好地维护自己的权益。
   • 寻求法律帮助：若公务员对调查过程或结果有异议，或认为自己的权益受到侵犯，可以寻求专业律师的法律帮助，以维护自己的合法权益。

总结来说，公务员被秘密调查的法律后果及影响取决于调查的具体情况、调查机关的权限以及调查结果。公务员应了解自己的法律权益和调查程序，积极配合调查机关的工作，并在必要时寻求法律帮助。如有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。