打了上班卡不在公司是否算旷工，并非一概而论，而是需要根据具体情况、公司规章制度以及相关法律法规进行综合判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
公司规章制度的角度：
- 如果公司规章制度中明确规定，员工打卡后必须留在公司履行工作职责，擅自离岗视为旷工，并且该规章制度已向员工公示或员工已知晓并同意遵守，那么员工打卡后不在公司且无正当理由的，通常会被认定为旷工。
- 规章制度的制定需符合《中华人民共和国劳动合同法》第四条的规定，即应经过合法程序制定并公示或告知劳动者。
实际情况与员工主观意图的角度：
- 即使公司规章制度没有明确规定，但如果员工打卡后不在公司的行为对工作的正常开展造成了实质性的影响，如导致工作流程中断、延误重要任务或给公司带来经济损失等，公司也有可能依据相关法律和事实认定该员工旷工。
- 另一方面，如果员工能够提供合理的解释或证明，如因突发事件（突发疾病、自然灾害、家庭紧急情况等）需要暂时离开公司，并且及时通知了相关负责人或事后提供了相关证明，那么这种情况通常不会被视为旷工。
特殊情况的角度：
- 员工因不可抗力因素导致无法继续在公司工作，并在事后及时向公司说明情况并提供相关证明的，不应认定为旷工。
- 如因公司自身原因（如工作安排不合理、工作场所安全隐患、劳动条件不符合要求等）导致员工无法在公司正常工作，员工打卡后不在公司的行为也不应被认定为旷工。
- 员工按照公司的指示或要求去完成其他与工作相关的合理任务而暂时离开公司的，同样不应认定为旷工。
针对此问题的法律建议：
对于员工：
- 如果因某些原因需要在打卡后暂时离开公司，应提前与上级或相关人员进行沟通，并确保自己的工作不会受到影响。
- 保留好相关的证据和记录，如请假条、通讯记录、工作任务安排等，以备不时之需。
对于公司：
- 制定和完善相关的规章制度，明确员工的行为规范及旷工的认定标准和处理方式。
- 确保规章制度经过合法程序制定并公示或告知员工，以减少争议和纠纷的发生。
- 在处理员工旷工问题时，应遵循公平、公正的原则，并依据事实和法律进行判定。
综上所述，打了上班卡不在公司是否算旷工是一个复杂的问题，需要综合考虑多种因素。如果您或您的公司面临此类问题，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更准确的法律建议。