结论：奶茶店周六天不让请假还扣两天工资的行为，一般不合法，但具体是否违法需结合劳动合同、规章制度及实际情况综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、从休息日与工资支付的角度分析
休息日安排：
- 根据《劳动法》及相关规定，劳动者每周至少应享受一天的休息日。若奶茶店周六日为正常休息日，则员工有权享受休息，店方无权强制要求上班。
- 若周六日为奶茶店的工作日（如因行业特性需周末营业），则员工需按合同约定工作，但店方应支付相应的加班工资或安排补休。
工资支付：
- 员工在休息日未提供劳动时，店方无权扣除工资。若员工因个人原因需请假，且请假符合店方规定及劳动合同约定，店方亦不应扣除工资。
- 若员工未请假或请假未获批准而擅自缺勤，店方可根据规章制度进行处罚，但处罚应合理且符合法律规定，不得随意扣除工资。
二、从规章制度与劳动合同的角度分析
规章制度：
- 奶茶店应制定合法、合理的规章制度，明确请假流程、工资支付等事项。若规章制度中规定周六日不让请假且扣工资，该规定可能因违反法律规定而无效。
- 员工应遵守店方的规章制度，但店方亦应确保规章制度的合法性与合理性。
劳动合同：
- 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。若劳动合同中未约定周六日不让请假且扣工资的内容，店方则无权单方面实施此类行为。
- 若劳动合同中有相关约定，但该约定违反法律强制性规定，则该约定无效。
三、从实际案例与法律后果的角度分析
实际案例：
- 在实践中，因休息日安排、工资支付等问题引发的劳动争议屡见不鲜。法院在审理此类案件时，通常会综合考虑劳动合同、规章制度、实际工作情况等因素，判断用人单位的行为是否合法。
法律后果：
- 若奶茶店的行为被认定为违法，可能面临支付拖欠工资、经济补偿金等法律责任。同时，还可能受到劳动行政部门的处罚，如罚款、责令改正等。
四、建议与措施
与店方协商：
- 员工可首先与奶茶店进行协商，明确周六日的安排及工资支付问题。若协商无果，可考虑采取其他措施。
向劳动行政部门投诉：
- 若认为奶茶店的行为违法，员工可向当地劳动行政部门投诉。劳动行政部门将依法进行调查处理，并保护员工的合法权益。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 若与店方协商无果且投诉未得到满意解决，员工可申请劳动仲裁或提起诉讼，通过法律途径维护自己的权益。
总结：奶茶店周六天不让请假还扣两天工资的行为，一般不合法。员工应了解自己的权益，并在必要时采取法律措施维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。