结论：针对您提出的“楼顶漏水是持久性的侵权问题，法院判决生效后没有完全修好，2年后又漏水，能否申请法院再次处理”的问题，您有权向法院申请强制执行原判决中未履行或未完全履行的部分，并可就新出现的漏水情况，考虑是否需要另行提起诉讼或与原执行程序合并处理。以下是对此问题的详细分析：

一、关于原判决的执行

1. 执行申请：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，如果一方当事人不履行法院生效判决所确定的义务，另一方当事人有权向法院申请强制执行。在您的情况下，如果原判决要求对方修复楼顶漏水问题，但对方未完全履行或未履行，您有权向法院申请强制执行原判决中未履行的部分。

2. 执行期限：虽然法律对执行期限有一定的规定，但执行程序并不因时间的流逝而自动终止。只要原判决仍然有效，且对方未履行或未完全履行判决义务，您就可以随时向法院申请强制执行。

二、关于新出现的漏水情况

1. 新情况的处理：如果楼顶在修复后2年又出现漏水问题，这可能构成一个新的侵权事实。您需要考虑这一新情况是否与原判决中的修复义务有关，以及是否需要对方承担新的修复责任。

2. 另行起诉或合并处理：

   • 另行起诉：如果新出现的漏水问题与原判决中的修复义务无直接关联，或者您认为原判决的修复义务已经履行完毕，但新问题是由于其他原因导致的，您可以考虑就新问题另行提起诉讼，要求对方承担修复责任或赔偿损失。
   • 合并处理：如果新出现的漏水问题与原判决中的修复义务有直接关联，且您认为对方在原判决执行过程中存在故意拖延、敷衍了事等行为，导致问题未得到根本解决，您可以在申请强制执行原判决的同时，向法院说明新情况，并请求法院将新问题纳入执行范围或作为新案件进行审理。

三、实际操作建议

1. 收集证据：在申请强制执行或另行起诉前，您需要收集相关证据，如楼顶漏水的照片、视频、维修记录、与对方的沟通记录等，以证明对方未履行或未完全履行修复义务，以及新出现的漏水问题与对方的行为有关。

2. 咨询律师：由于法律程序复杂且涉及专业法律知识，建议您在申请强制执行或另行起诉前咨询专业律师（即向我咨询），以便更好地了解您的权利和义务，以及如何有效地维护自己的合法权益。

3. 关注时效：虽然执行程序不因时间的流逝而自动终止，但您仍需关注诉讼时效问题。如果新出现的漏水问题构成一个新的侵权事实，您需要在法定的诉讼时效期间内提起诉讼或申请仲裁。

综上所述，您有权向法院申请强制执行原判决中未履行或未完全履行的部分，并可就新出现的漏水情况考虑是否需要另行提起诉讼或与原执行程序合并处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。