关于公务员工伤停工留薪期的确定问题，这并非完全由职工所在的单位单方面决定，而是需要依据多个方面的因素来综合判定。
首先，我们要明确停工留薪期的基本概念。根据《工伤保险条例》的相关规定，当职工因工作遭受事故伤害或患职业病需要暂停工作接受工伤医疗时，他们有权享受停工留薪期待遇。在此期间，职工的原工资福利待遇保持不变，并由所在单位按月支付。
接下来，我们详细探讨停工留薪期的确定方式：
医疗机构诊断证明：这是停工留薪期初步确定的重要依据。工伤职工需要就诊于签订服务协议的医疗机构或工伤康复机构，并获取这些机构出具的休假证明。这些证明文件能够详细反映职工的伤情和需要休息的时间，是评估停工留薪期的基础。
地方停工留薪期分类目录：为了更规范地管理停工留薪期，许多地方会根据不同的工伤部位和伤害程度，制定《工伤职工停工留薪期分类目录》。这个目录为各类工伤伤害提供了停工留薪期的参考范围，有助于更准确地确定具体期限。
然而，停工留薪期的确定并非仅止于此。在过程中，用人单位也有一定的参与权。他们可以对员工的伤情进行了解和评估，对员工提交的医院诊断证明和休假建议进行审核。但值得注意的是，用人单位并没有最终的决定权。
如果用人单位与工伤职工就停工留薪期的具体期限发生争议，或者停工留薪期超过了12个月，那么就需要经过设区的市级劳动能力鉴定委员会的确认。这个委员会会依据相关的标准和实际情况进行鉴定，并作出是否延长停工留薪期以及延长的具体期限的结论。这一结论具有权威性和最终效力，确保了停工留薪期确定的公正性和准确性。
综上所述，公务员工伤停工留薪期的确定是一个涉及多个环节和多方参与的复杂过程。它不仅依赖于医疗机构的诊断证明和地方分类目录的参考，还受到劳动能力鉴定委员会的最终确认。因此，无论是用人单位还是工伤职工，都应充分了解相关法律法规和程序要求，以确保停工留薪期的合理确定和权益的有效保障。