结论前置：单位一般不能直接通过起诉员工的方式追索未足额支付的公积金，但可以通过其他合法途径解决该问题。

1. 公积金缴纳的性质与责任主体
   根据《住房公积金管理条例》的规定，住房公积金的缴纳是单位与员工共同的法定义务。单位未足额为员工缴纳公积金的，责任主体是单位，而非员工。员工有权要求单位补缴，但单位不能因此起诉员工要求返还或追索。

2. 单位追索公积金的常见误解
   如果单位认为员工未足额支付个人应缴部分（例如从工资中代扣的部分），需明确：

   • 员工个人应缴部分由单位从工资中代扣代缴，若单位未代扣或代扣不足，责任仍在单位；
     
   • 单位无权直接起诉员工要求支付公积金，但可通过内部管理（如扣发工资补缴）或向住房公积金管理中心投诉解决。

3. 合法解决途径

   • 向住房公积金管理中心投诉：单位未足额缴纳公积金的，管理中心有权责令限期缴存，逾期不缴的可申请法院强制执行。
     
   • 劳动仲裁或诉讼：若因公积金问题引发劳动争议（如单位以未缴公积金为由克扣工资），员工可申请仲裁或起诉单位，但单位不能反向起诉员工。
     
   • 内部协商：单位可与员工协商补缴方案，但需符合法律规定。

4. 特殊情形：员工自愿放弃公积金的效力
   即使员工签署“自愿放弃公积金”的协议，该协议也因违反强制性规定而无效。单位仍需补缴，且不能以此为由追究员工责任。

总结建议：
单位应优先通过住房公积金管理中心或内部协商解决未足额缴纳问题，而非直接起诉员工。若涉及复杂争议，可进一步向我咨询具体操作流程。