该行为存在一定法律风险，是否合法需分情况讨论，具体分析如下：

1. 关于建房许可证的申请主体
   根据《土地管理法》及《城乡规划法》，农村建房需以实际建房人名义申请建房许可，且需符合“一户一宅”原则。若弟弟作为户主申请建房许可，但实际出资人与使用人为哥哥，可能涉及以下问题：
   

• 许可主体与实际不符：若建房后房屋实际由哥哥使用或登记在哥哥名下，可能因“借名建房”被认定为违规，面临行政处罚（如责令拆除、罚款等）。
  
• 宅基地使用权争议：若弟弟已拥有宅基地，再以弟弟名义申请建房可能违反“一户一宅”原则，导致许可无效。

1. 关于共同出资的合法性
   哥哥与弟弟的共同出资行为本身不违法，但需满足以下条件：
   

• 明确约定权属：双方应签订书面协议，明确房屋产权归属（如按份共有或共同共有）、使用权限及后续处置方式（如转让、继承等）。若无书面协议，可能因权属不清引发纠纷。
  
• 符合宅基地分配政策：若哥哥本身符合宅基地申请条件（如未分户且无宅基地），可尝试以哥哥名义申请建房许可，避免“借名”风险。

1. 法律风险防范建议
   

• 优先以实际使用人名义申请：若哥哥符合宅基地申请条件，建议以哥哥名义申请建房许可，避免主体不符问题。
  
• 签订书面协议：无论以谁名义申请，兄弟双方应签订书面协议，明确出资比例、产权归属及责任分担，必要时可公证或律师见证。
  
• 咨询当地部门：农村建房政策因地区而异，建议提前咨询当地自然资源局或乡镇政府，确认具体操作流程及合规要求。

总结：口头协议以弟弟名义申请建房许可与哥哥共同出资的行为存在法律风险，可能因主体不符或权属不清导致行政处罚或民事纠纷。建议通过书面协议明确权责，并优先以符合条件的实际使用人名义申请许可。如有进一步疑问，可直接向我咨询。