村书记入股的公司参与村自建房建设，并不直接构成违法乱纪，但关键在于是否存在违法行为或利益冲突。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 村书记的身份与职责

• 村书记作为村干部，有责任确保村务的公正、公平和公开。
• 村书记在履行职务时，应遵守相关法律法规，不得利用职权谋取私利。

二. 公司入股与村自建房建设的关系

• 村书记入股的公司参与村自建房建设，本身并不违法。
• 但如果村书记利用职权为公司谋取特殊利益，如未经公开招标、违规审批等，则构成违法行为。

三. 可能涉及的违法行为

1. 贪污受贿：如果村书记在公司参与村自建房建设过程中收受财物，或要求公司给予不正当利益，则构成贪污受贿。
2. 滥用职权：如果村书记利用职权为公司提供便利，损害村集体或其他村民的利益，则构成滥用职权。
3. 利益冲突：如果村书记的行为导致个人利益与村集体利益发生冲突，且未进行适当披露或回避，则可能构成利益冲突。

四. 法律后果

• 如果村书记存在上述违法行为，将依法承担法律责任，包括但不限于行政处罚、刑事处罚等。
• 同时，村书记的违法行为还可能损害其个人声誉和职务前途。

综上所述，村书记入股的公司参与村自建房建设并不直接违法，但关键在于村书记在其中的行为是否合法、合规。我建议村书记在参与此类活动时，应严格遵守相关法律法规和职业道德规范，确保村务的公正、公平和公开。同时，村民和相关部门也应加强监督，防止违法乱纪行为的发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。