船舶码头自行沉没的赔偿问题需根据具体原因和责任主体来确定，以下分情况说明核心结论：

1. 若因码头自身结构缺陷或维护不当导致沉没
   根据《民法典》第1165条，码头管理方或所有权人若未尽到安全保障义务（如未定期检修、未设置警示标志等），需对沉没造成的损失承担侵权责任。赔偿范围包括：

   • 船舶本身的损失（如修复费用、残值损失）；
     
   • 船舶内货物的损失（需证明货物价值及与沉没的因果关系）；
     
   • 因沉没引发的第三方损失（如碰撞其他船舶、污染环境等）。
     例外：若管理方能证明已尽到合理义务（如按规范维护、设置警示标志），可减轻或免除责任。

2. 若因不可抗力（如极端天气、地震）导致沉没
   根据《民法典》第180条，因不可抗力不能履行民事义务的，一般不承担责任，但法律另有规定的除外。此时需满足：

   • 事件具有不可预见性、不可避免性、不可克服性；
     
   • 管理方已采取合理措施防止损失扩大（如加固码头、提前疏散船舶）。
     注意：若管理方未采取必要措施，仍可能承担部分责任。

3. 若因第三方行为（如其他船舶撞击、人为破坏）导致沉没
   根据《民法典》第1165条，侵权方需对沉没造成的损失承担赔偿责任。赔偿范围同第1点，但需证明侵权行为与沉没的直接因果关系。
   特殊情形：若第三方为无民事行为能力人（如儿童），其监护人需承担赔偿责任；若第三方逃逸，码头管理方可先赔偿后追偿（如有保险可申请理赔）。

4. 若船舶自身原因（如超载、操作失误）导致沉没
   船舶所有人或经营人需自行承担损失，但若码头管理方存在过错（如未限制超载船舶停靠），可能需按过错比例分担责任。
   示例：码头未设置载重限制标志，导致超载船舶沉没，管理方可能承担20%-50%责任。

建议行动步骤：

1. 立即固定证据（如拍照、录像、保存维修记录）；
   
2. 委托专业机构鉴定沉没原因（如海事局、第三方检测机构）；
   
3. 根据责任主体协商赔偿，协商不成可向海事法院起诉；
   
4. 若涉及保险（如船舶险、码头责任险），及时报案并配合调查。
   

如有进一步细节（如沉没原因、损失金额、合同条款等），可直接向我咨询，我会结合具体情形为您分析。