商标侵权涉及100万金额的情况下，双方仍然可以进行调解。以下是对这一问题的详细分析：

1. 法律依据支持调解：

   • 根据《商标法》的相关规定，侵犯商标专用权的赔偿数额确定方法包括当事人自行协商。这意味着，在商标侵权纠纷中，双方当事人有权通过协商达成和解，包括调解这一形式。
   • 同时，在诉讼或行政处理过程中，法院或工商部门也可以基于自愿、合法的原则对双方进行调解。这为调解解决商标侵权纠纷提供了坚实的法律基础。

2. 调解的优势：

   • 节省时间和成本：调解可以避免漫长的诉讼程序，双方当事人可以在较短的时间内达成和解协议，从而快速解决纠纷，节省时间和诉讼成本。
   • 维护商业关系和声誉：相比于诉讼等对抗性较强的解决方式，调解更注重双方当事人的沟通和协商，有助于保持双方之间的友好合作关系，维护商业声誉。
   • 灵活性高：调解过程相对灵活，双方可以根据实际情况和需求，在调解协议中约定具体的赔偿金额、支付方式、违约责任等条款，满足双方的个性化需求。

3. 调解的具体操作：

   • 第三方调解机构：如果双方当事人都愿意进行调解，可以寻求第三方调解机构的帮助，如人民调解委员会、行政调解机构等。这些机构通常具有丰富的调解经验和专业的法律知识，能够为双方当事人提供更加专业、公正的调解服务。
   • 自行协商：双方当事人也可以选择自行协商达成和解协议，这也是一种有效的调解方式。在自行协商过程中，双方可以充分表达自己的诉求和意见，通过友好协商达成共识。

4. 调解的注意事项：

   • 自愿性：调解结果需要双方自愿接受，不能强迫任何一方接受调解协议。如果一方不同意调解结果，仍然可以选择通过诉讼等方式来解决商标侵权纠纷。
   • 合法性：调解协议的内容必须合法，不能违反法律法规的强制性规定。否则，调解协议可能被认定为无效或被撤销。
   • 执行力：调解协议本身不具有强制执行力。如果一方不履行调解协议，另一方需要向人民法院申请强制执行或通过其他合法途径来维护自己的权益。

建议：在商标侵权纠纷中，如果双方愿意通过调解来解决纠纷，可以积极寻求第三方调解机构的帮助或自行协商达成和解协议。但同时，也要做好调解不成或一方不履行调解协议的准备，及时通过诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。如果您在商标侵权纠纷中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。