商标侵权被起诉赔偿是可以协商的。在商标侵权纠纷中，双方当事人有自主协商解决纠纷的权利。具体来说：

1. 协商的可行性：商标侵权被诉后，双方可以友好协商，达成和解协议。侵权方需要承认侵权并承担相应的责任，如停止侵权行为、赔偿损失等。被侵权方可以根据实际情况提出合理的赔偿等和解条件。协商达成的协议具有法律效力，双方需按约履行义务。

2. 协商的优势：协商解决商标侵权纠纷较为灵活经济，能够避免诉讼成本，节省时间和资源。同时，协商也有助于维护双方的商业关系和声誉，避免对抗性较强的诉讼方式带来的负面影响。

3. 协商不成时的处理：如果双方协商不成，被侵权方可以通过法律途径维权，由法院进行判决。在诉讼过程中，法院会依据相关法律法规和事实证据，对侵权行为进行认定，并作出相应的判决。

综上所述，商标侵权被起诉赔偿是可以协商的，且协商具有诸多优势。如果双方能够达成和解协议，将有助于快速解决纠纷，维护双方的合法权益。当然，如果协商不成，也可以通过法律途径来寻求解决方案。