虚开发票套取科研经费用于科研，属于违法行为，会面临严厉的法律处罚，包括行政处罚和刑事处罚。以下从不同角度进行详细分析：
一、行政处罚角度
- 税务处罚：虚开发票是违反税收法律法规的行为。根据《中华人民共和国税收征收管理法》及相关规定，税务机关有权对虚开发票的行为进行查处，并处以罚款、没收违法所得等行政处罚。对于套取的科研经费，税务机关可能会要求补缴税款，并加收滞纳金。
- 科研经费管理处罚：科研经费通常有严格的管理规定和使用范围。虚开发票套取科研经费，违反了科研经费的管理制度。科研管理部门或资助机构可能会对涉事单位或个人进行处罚，如要求退还套取的经费、限制未来申请科研经费的资格等。
二、刑事处罚角度
- 虚开发票罪：根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条之一的规定，虚开增值税专用发票或者虚开用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金；虚开的税款数额较大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金；虚开的税款数额巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产。虽然科研经费可能不涉及增值税专用发票，但虚开发票的行为性质相同，若达到刑事立案标准，同样会受到刑事处罚。
- 贪污罪或挪用公款罪：如果套取科研经费的行为涉及国家工作人员，且具有非法占有目的，可能构成贪污罪；如果只是暂时挪用，则可能构成挪用公款罪。这两种罪名都会受到严厉的刑事处罚，包括有期徒刑、无期徒刑甚至死刑（在贪污罪中，数额特别巨大且情节特别严重的）。
三、其他后果
- 声誉损害：虚开发票套取科研经费的行为一旦曝光，会对涉事单位或个人的声誉造成极大损害。这不仅会影响未来的科研合作和项目申请，还可能对个人的职业发展产生长远影响。
- 内部纪律处分：对于涉事单位或组织内部，还可能对涉事人员进行纪律处分，如警告、记过、降级、撤职甚至开除等。
建议：
- 立即停止违法行为：一旦发现存在虚开发票套取科研经费的行为，应立即停止，并主动向相关部门报告情况。
- 积极配合调查：在相关部门进行调查时，应积极配合，提供真实、完整的证据和信息。
- 寻求法律帮助：如果面临法律处罚或诉讼，应及时寻求专业法律帮助，以维护自身合法权益。
提醒：科研经费的使用应严格遵守相关法律法规和管理制度，确保合法、合规、透明。任何试图通过不正当手段套取科研经费的行为都是违法的，必将受到法律的严惩。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。