虚开发票套取10000元经费属于违法行为，可能面临行政处罚甚至刑事责任，具体处理方式需结合行为性质、情节严重程度及主观意图综合判断。以下从法律责任、处理流程、风险防范三个角度展开分析：
一、法律责任：行政处罚与刑事追责的边界
行政处罚（税务领域）
根据《中华人民共和国发票管理办法》第三十七条，虚开发票（包括为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，或让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票）的，由税务机关没收违法所得；虚开金额在1万元以下的，可并处5万元以下的罚款；虚开金额超过1万元的，并处5万元以上50万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
本案中套取10000元经费，若被认定为虚开发票，可能面临5万元以下罚款及没收违法所得。
刑事责任（刑法领域）
根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条之一，虚开发票罪指“虚开本法第二百零五条规定以外的其他发票，情节严重的”，处二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；情节特别严重的，处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
“情节严重”的认定标准通常包括虚开金额、次数、后果等。虽然10000元单次金额未达部分地区刑事立案标准（如部分省份规定虚开税款数额1万元以上或造成国家税款损失5000元以上），但若存在多次虚开、团伙作案、伪造公章等情节，仍可能被追究刑事责任。
二、处理流程：从发现到追责的关键环节
税务稽查阶段
税务机关通过发票比对、资金流向核查、上下游企业调查等方式发现虚开行为后，会向涉案单位或个人发出《税务检查通知书》，要求提供账簿、合同、付款凭证等材料。若确认虚开，会作出《税务处理决定书》和《税务行政处罚决定书》，责令补缴税款、滞纳金，并处罚款。
刑事立案阶段
若税务机关认为行为涉嫌犯罪，会移送公安机关立案侦查。公安机关会调查虚开发票的流程（如是否伪造合同、虚构交易）、资金回流路径（如套取经费后是否转入个人账户）、主观故意（如是否明知无真实业务）等。若证据充分，会提请检察院批准逮捕并起诉。
司法审判阶段
法院会根据虚开金额、主观恶性、社会危害性等量刑。例如，若虚开金额累计达10万元以上，或5年内因虚开发票受过2次以上行政处罚又虚开的，可能被认定为“情节严重”。
三、风险防范：合规建议与应对策略
立即停止违法行为
若已实施虚开发票行为，应第一时间停止，避免继续套取经费或扩大金额，防止从“行政违法”升级为“刑事犯罪”。
主动配合调查
收到税务或公安调查通知后，应如实提供材料，避免隐瞒或伪造证据。若存在从轻情节（如初犯、主动退赃、认罪认罚），可在处罚或量刑时争取从宽处理。
完善内部合规制度
单位应建立发票审核机制（如核对合同、物流单据、付款记录是否一致），禁止“以票代账”或“无真实业务开票”；个人应避免参与或协助虚开发票，防止成为共犯。
温馨提示：虚开发票套取经费的本质是“以合法形式掩盖非法目的”，无论金额大小，均存在法律风险。若您或所在单位涉及此类问题，可直接向我咨询具体应对方案，我会结合证据情况提供法律意见。