个人与公司签订的玻璃幕墙安装破损协议，在符合法律规定且双方意思表示真实的情况下，是有效且合法的。以下从不同角度为您详细分析：

协议有效的法律基础

1. 合同成立要件：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同成立需要满足双方意思表示真实、内容合法且不违反公序良俗等基本条件。若个人与公司签订的玻璃幕墙安装破损协议满足这些条件，则合同成立并有效。

2. 合同内容合法性：

   • 协议内容应明确双方的权利和义务，包括但不限于安装标准、破损责任、赔偿方式等。只要这些内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不损害国家、集体或第三人的利益，就是合法的。

协议可能无效或可撤销的情形

1. 意思表示不真实：

   • 如果一方在签订协议时存在欺诈、胁迫或乘人之危等情形，导致对方意思表示不真实，那么受损害方有权请求法院或仲裁机构撤销该协议。

2. 内容违法或违反公序良俗：

   • 如果协议内容违反法律、行政法规的强制性规定，或者违背公序良俗（如约定非法活动、损害社会公共利益等），则协议无效。

3. 格式条款问题：

   • 如果协议是公司提供的格式条款，且存在免除其责任、加重对方责任、排除对方主要权利等情形，那么该格式条款可能无效。但需要注意的是，这并不影响整个协议的效力，除非该格式条款是协议的主要内容。

实际操作中的建议

1. 审查协议内容：

   • 在签订协议前，双方应仔细审查协议内容，确保条款明确、合法且公平合理。如有疑问，可咨询专业律师进行审查。

2. 保留证据：

   • 双方应妥善保管与协议相关的证据，如安装记录、破损照片、沟通记录等。这些证据在发生纠纷时可能起到关键作用。

3. 及时解决纠纷：

   • 如果在协议履行过程中发生纠纷，双方应首先尝试通过协商解决。如协商无果，可依法向法院提起诉讼或申请仲裁。

总结与建议：个人与公司签订的玻璃幕墙安装破损协议，在符合法律规定且双方意思表示真实的情况下，是有效且合法的。但为了避免潜在的法律风险，双方在签订协议前应仔细审查协议内容，并保留好相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。