结论前置：银行员工套现被发现后虽已全部还款，但仍可能面临行政处罚、内部纪律处分，甚至刑事责任，具体后果需结合套现金额、情节严重性等因素综合判断。以下从法律责任、内部处理、风险防范三个角度展开分析：

1. 法律责任：可能涉及行政处罚与刑事风险

• 行政处罚：根据《中国人民银行关于信用卡业务有关事项的通知》及《支付结算办法》，套现行为违反金融管理秩序，即使已还款，银行仍可向监管部门（如银保监会）举报，员工可能面临罚款、行业禁入等行政处罚。
• 刑事责任：若套现金额巨大（通常个人套现达100万元以上，或造成金融机构损失超50万元），可能构成《刑法》第196条“信用卡诈骗罪”或第225条“非法经营罪”。即使还款，若存在伪造交易、虚构用途等情节，仍可能被追究刑事责任。

2. 内部处理：银行纪律处分与行业影响

• 纪律处分：银行内部规章制度通常明确禁止员工参与套现，即使已还款，员工仍可能面临警告、记过、降职、解雇等处分，且处分记录可能影响未来职业晋升。
• 行业声誉：银行员工套现行为可能被纳入金融行业黑名单，影响其在其他金融机构的就业机会，甚至波及整个职业生涯。

3. 风险防范：主动补救与合规建议

• 主动说明情况：若套现行为尚未被银行正式立案，员工可主动向银行合规部门坦白，配合调查并提交还款证明，争取从轻处理。
• 完善证据链：保留还款凭证、交易记录等材料，证明套现行为未造成实际损失，降低被认定为“恶意套现”的风险。
• 合规培训：未来需严格遵守银行内部合规规定，避免参与任何形式的资金违规操作，必要时可要求银行提供合规培训。

补充说明：若套现行为涉及第三方（如协助他人套现），则可能进一步扩大法律责任范围。建议根据具体情节（如套现次数、金额、是否获利等），委托律师评估风险并制定应对方案。如有进一步疑问，可直接向我咨询金融合规领域问题。